RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.46■■■□□ 2.15
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USP40-217ENST00000496298 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
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USP40-217ENST00000496298 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.43■■■□□ 2.14
USP40-217ENST00000496298 ORAI2Q96SN7 254 aa28.43■■■□□ 2.14
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USP40-217ENST00000496298 DLC1Q96QB1 1528 aa28.37■■■□□ 2.13
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USP40-217ENST00000496298 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
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USP40-217ENST00000496298 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
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USP40-217ENST00000496298 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.22■■■□□ 2.11
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USP40-217ENST00000496298 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.15■■■□□ 2.1
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USP40-217ENST00000496298 ATP7BP35670 1465 aa27.97■■■□□ 2.07
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USP40-217ENST00000496298 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.83■■■□□ 2.05
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USP40-217ENST00000496298 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
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