RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERBP1-208	ENST00000493607	ADGRB1	O14514	1584 aa		34.04	■■■■□ 3.04
SERBP1-208	ENST00000493607	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		34.04	■■■■□ 3.04
SERBP1-208	ENST00000493607	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		34.02	■■■■□ 3.04
SERBP1-208	ENST00000493607	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		34	■■■■□ 3.03
SERBP1-208	ENST00000493607	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		33.98	■■■■□ 3.03
SERBP1-208	ENST00000493607	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		33.97	■■■■□ 3.03
SERBP1-208	ENST00000493607	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	33.95	■■■■□ 3.03
SERBP1-208	ENST00000493607	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		33.94	■■■■□ 3.02
SERBP1-208	ENST00000493607	SOCS7	O14512	581 aa		33.94	■■■■□ 3.02
SERBP1-208	ENST00000493607	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		33.94	■■■■□ 3.02
SERBP1-208	ENST00000493607	ORAI2	Q96SN7	254 aa		33.92	■■■■□ 3.02
SERBP1-208	ENST00000493607	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	33.91	■■■■□ 3.02
SERBP1-208	ENST00000493607	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	33.9	■■■■□ 3.02
SERBP1-208	ENST00000493607	ADGRB2	O60241	1585 aa		33.89	■■■■□ 3.02
SERBP1-208	ENST00000493607	LRP6	O75581	1613 aa		33.88	■■■■□ 3.01
SERBP1-208	ENST00000493607	PRAM1	Q96QH2	718 aa		33.86	■■■■□ 3.01
SERBP1-208	ENST00000493607	KIF1A	Q12756	1690 aa		33.85	■■■■□ 3.01
SERBP1-208	ENST00000493607	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
SERBP1-208	ENST00000493607	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33.84	■■■■□ 3.01
SERBP1-208	ENST00000493607	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		33.83	■■■■□ 3.01
SERBP1-208	ENST00000493607	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		33.83	■■■■□ 3.01
SERBP1-208	ENST00000493607	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	33.8	■■■■□ 3
SERBP1-208	ENST00000493607	POGK	Q9P215	609 aa		33.8	■■■■□ 3
SERBP1-208	ENST00000493607	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
SERBP1-208	ENST00000493607	PXDN	Q92626	1479 aa		33.78	■■■■□ 3
SERBP1-208	ENST00000493607	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		33.78	■■■■□ 3
SERBP1-208	ENST00000493607	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.78	■■■■□ 3
SERBP1-208	ENST00000493607	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
SERBP1-208	ENST00000493607	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		33.77	■■■■□ 3
SERBP1-208	ENST00000493607	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
SERBP1-208	ENST00000493607	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
SERBP1-208	ENST00000493607	USP32	Q8NFA0	1604 aa		33.71	■■■□□ 2.99
SERBP1-208	ENST00000493607	NUTM2F	A1L443	756 aa		33.71	■■■□□ 2.99
SERBP1-208	ENST00000493607	FOXO3	O43524	673 aa		33.71	■■■□□ 2.99
SERBP1-208	ENST00000493607	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	33.71	■■■□□ 2.99
SERBP1-208	ENST00000493607	POTEA	Q6S8J7	498 aa		33.71	■■■□□ 2.99
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
SERBP1-208	ENST00000493607	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		33.67	■■■□□ 2.98
SERBP1-208	ENST00000493607	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
SERBP1-208	ENST00000493607	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
SERBP1-208	ENST00000493607	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
SERBP1-208	ENST00000493607	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		33.66	■■■□□ 2.98
SERBP1-208	ENST00000493607	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		33.66	■■■□□ 2.98
SERBP1-208	ENST00000493607	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.65	■■■□□ 2.98
SERBP1-208	ENST00000493607	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
SERBP1-208	ENST00000493607	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
SERBP1-208	ENST00000493607	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		33.6	■■■□□ 2.97
SERBP1-208	ENST00000493607	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		33.6	■■■□□ 2.97
SERBP1-208	ENST00000493607	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		33.59	■■■□□ 2.97
SERBP1-208	ENST00000493607	ITSN1	Q15811	1721 aa		33.59	■■■□□ 2.97
SERBP1-208	ENST00000493607	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
SERBP1-208	ENST00000493607	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
SERBP1-208	ENST00000493607	PSME1	Q06323	249 aa		33.57	■■■□□ 2.96
SERBP1-208	ENST00000493607	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		33.57	■■■□□ 2.96
SERBP1-208	ENST00000493607	SBNO1	A3KN83	1393 aa		33.57	■■■□□ 2.96
SERBP1-208	ENST00000493607	AFF2	P51816	1311 aa		33.55	■■■□□ 2.96
SERBP1-208	ENST00000493607	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
SERBP1-208	ENST00000493607	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		33.54	■■■□□ 2.96
SERBP1-208	ENST00000493607	NEUROD1	Q13562	356 aa		33.54	■■■□□ 2.96
SERBP1-208	ENST00000493607	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		33.53	■■■□□ 2.96
SERBP1-208	ENST00000493607	ATP7B	P35670	1465 aa		33.52	■■■□□ 2.96
SERBP1-208	ENST00000493607	C8orf37	Q96NL8	207 aa		33.51	■■■□□ 2.95
SERBP1-208	ENST00000493607	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
SERBP1-208	ENST00000493607	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
SERBP1-208	ENST00000493607	ADAMTS2	O95450	1211 aa		33.48	■■■□□ 2.95
SERBP1-208	ENST00000493607	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		33.48	■■■□□ 2.95
SERBP1-208	ENST00000493607	ARHGEF10	O15013	1369 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SERBP1-208	ENST00000493607	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
SERBP1-208	ENST00000493607	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
SERBP1-208	ENST00000493607	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		33.46	■■■□□ 2.95
SERBP1-208	ENST00000493607	NGLY1	Q96IV0	654 aa		33.46	■■■□□ 2.95
SERBP1-208	ENST00000493607	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		33.45	■■■□□ 2.95
SERBP1-208	ENST00000493607	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
SERBP1-208	ENST00000493607	CDK19	Q9BWU1	502 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SERBP1-208	ENST00000493607	ALS2	Q96Q42	1657 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SERBP1-208	ENST00000493607	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SERBP1-208	ENST00000493607	RXRB	P28702	533 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SERBP1-208	ENST00000493607	ABCA3	Q99758	1704 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SERBP1-208	ENST00000493607	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
SERBP1-208	ENST00000493607	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SERBP1-208	ENST00000493607	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
SERBP1-208	ENST00000493607	TONSL	Q96HA7	1378 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SERBP1-208	ENST00000493607	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
SERBP1-208	ENST00000493607	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
SERBP1-208	ENST00000493607	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
SERBP1-208	ENST00000493607	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
SERBP1-208	ENST00000493607	USP21	Q9UK80	565 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SERBP1-208	ENST00000493607	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SERBP1-208	ENST00000493607	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SERBP1-208	ENST00000493607	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
SERBP1-208	ENST00000493607	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SERBP1-208	ENST00000493607	ATRN	O75882	1429 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SERBP1-208	ENST00000493607	SLIT2	O94813	1529 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SERBP1-208	ENST00000493607	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SERBP1-208	ENST00000493607	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SERBP1-208	ENST00000493607	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SERBP1-208	ENST00000493607	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SERBP1-208	ENST00000493607	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
SERBP1-208	ENST00000493607	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SERBP1-208	ENST00000493607	ACE	P12821	1306 aa		33.27	■■■□□ 2.92

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