RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490751.1

LDB1-204, Transcript of LIM domain binding 1, human

TSL 2

Gene LDB1, Length 762 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LDB1-204	ENST00000490751	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		45.95	■■■■■ 4.95
LDB1-204	ENST00000490751	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	45.94	■■■■■ 4.94
LDB1-204	ENST00000490751	LRP6	O75581	1613 aa		45.94	■■■■■ 4.94
LDB1-204	ENST00000490751	ORAI2	Q96SN7	254 aa		45.92	■■■■■ 4.94
LDB1-204	ENST00000490751	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	45.91	■■■■■ 4.94
LDB1-204	ENST00000490751	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		45.88	■■■■■ 4.94
LDB1-204	ENST00000490751	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		45.87	■■■■■ 4.93
LDB1-204	ENST00000490751	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	45.86	■■■■■ 4.93
LDB1-204	ENST00000490751	SIRT1	Q96EB6	747 aa		45.84	■■■■■ 4.93
LDB1-204	ENST00000490751	ADGRB1	O14514	1584 aa		45.81	■■■■■ 4.92
LDB1-204	ENST00000490751	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	45.8	■■■■■ 4.92
LDB1-204	ENST00000490751	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		45.8	■■■■■ 4.92
LDB1-204	ENST00000490751	POTEA	Q6S8J7	498 aa		45.79	■■■■■ 4.92
LDB1-204	ENST00000490751	STAC3	Q96MF2	364 aa		45.78	■■■■■ 4.92
LDB1-204	ENST00000490751	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		45.77	■■■■■ 4.92
LDB1-204	ENST00000490751	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		45.76	■■■■■ 4.92
LDB1-204	ENST00000490751	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	45.76	■■■■■ 4.92
LDB1-204	ENST00000490751	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	45.76	■■■■■ 4.92
LDB1-204	ENST00000490751	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	45.76	■■■■■ 4.92
LDB1-204	ENST00000490751	DLC1	Q96QB1	1528 aa		45.76	■■■■■ 4.92
LDB1-204	ENST00000490751	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	45.76	■■■■■ 4.92
LDB1-204	ENST00000490751	NUTM2F	A1L443	756 aa		45.75	■■■■■ 4.91
LDB1-204	ENST00000490751	PRAM1	Q96QH2	718 aa		45.72	■■■■■ 4.91
LDB1-204	ENST00000490751	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	45.68	■■■■■ 4.9
LDB1-204	ENST00000490751	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		45.67	■■■■■ 4.9
LDB1-204	ENST00000490751	POGK	Q9P215	609 aa		45.65	■■■■■ 4.9
LDB1-204	ENST00000490751	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		45.64	■■■■■ 4.9
LDB1-204	ENST00000490751	PXDN	Q92626	1479 aa		45.61	■■■■■ 4.89
LDB1-204	ENST00000490751	KIF1A	Q12756	1690 aa		45.61	■■■■■ 4.89
LDB1-204	ENST00000490751	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	45.61	■■■■■ 4.89
LDB1-204	ENST00000490751	FOXO3	O43524	673 aa		45.6	■■■■■ 4.89
LDB1-204	ENST00000490751	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	45.58	■■■■■ 4.89
LDB1-204	ENST00000490751	ADGRB2	O60241	1585 aa		45.58	■■■■■ 4.89
LDB1-204	ENST00000490751	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	45.55	■■■■■ 4.88
LDB1-204	ENST00000490751	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	45.55	■■■■■ 4.88
LDB1-204	ENST00000490751	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	45.52	■■■■■ 4.88
LDB1-204	ENST00000490751	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		45.52	■■■■■ 4.88
LDB1-204	ENST00000490751	AFF2	P51816	1311 aa		45.5	■■■■■ 4.87
LDB1-204	ENST00000490751	C8orf37	Q96NL8	207 aa		45.48	■■■■■ 4.87
LDB1-204	ENST00000490751	USP32	Q8NFA0	1604 aa		45.48	■■■■■ 4.87
LDB1-204	ENST00000490751	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	45.46	■■■■■ 4.87
LDB1-204	ENST00000490751	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	45.46	■■■■■ 4.87
LDB1-204	ENST00000490751	ADAMTS2	O95450	1211 aa		45.45	■■■■■ 4.87
LDB1-204	ENST00000490751	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		45.45	■■■■■ 4.87
LDB1-204	ENST00000490751	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		45.44	■■■■■ 4.87
LDB1-204	ENST00000490751	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		45.38	■■■■■ 4.86
LDB1-204	ENST00000490751	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		45.36	■■■■■ 4.85
LDB1-204	ENST00000490751	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	45.35	■■■■■ 4.85
LDB1-204	ENST00000490751	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		45.35	■■■■■ 4.85
LDB1-204	ENST00000490751	NGLY1	Q96IV0	654 aa		45.35	■■■■■ 4.85
LDB1-204	ENST00000490751	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		45.35	■■■■■ 4.85
LDB1-204	ENST00000490751	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	45.33	■■■■■ 4.85
LDB1-204	ENST00000490751	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		45.32	■■■■■ 4.85
LDB1-204	ENST00000490751	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		45.32	■■■■■ 4.85
LDB1-204	ENST00000490751	RXRB	P28702	533 aa		45.31	■■■■■ 4.84
LDB1-204	ENST00000490751	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		45.31	■■■■■ 4.84
LDB1-204	ENST00000490751	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	45.3	■■■■■ 4.84
LDB1-204	ENST00000490751	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		45.29	■■■■■ 4.84
LDB1-204	ENST00000490751	PSME1	Q06323	249 aa		45.29	■■■■■ 4.84
LDB1-204	ENST00000490751	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		45.28	■■■■■ 4.84
LDB1-204	ENST00000490751	NEUROD1	Q13562	356 aa		45.27	■■■■■ 4.84
LDB1-204	ENST00000490751	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	45.23	■■■■■ 4.83
LDB1-204	ENST00000490751	SBNO1	A3KN83	1393 aa		45.22	■■■■■ 4.83
LDB1-204	ENST00000490751	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	45.21	■■■■■ 4.83
LDB1-204	ENST00000490751	ITSN1	Q15811	1721 aa		45.21	■■■■■ 4.83
LDB1-204	ENST00000490751	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	45.19	■■■■■ 4.82
LDB1-204	ENST00000490751	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	45.19	■■■■■ 4.82
LDB1-204	ENST00000490751	USP21	Q9UK80	565 aa		45.19	■■■■■ 4.82
LDB1-204	ENST00000490751	ATP7B	P35670	1465 aa		45.18	■■■■■ 4.82
LDB1-204	ENST00000490751	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	45.17	■■■■■ 4.82
LDB1-204	ENST00000490751	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		45.16	■■■■■ 4.82
LDB1-204	ENST00000490751	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	45.15	■■■■■ 4.82
LDB1-204	ENST00000490751	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		45.14	■■■■■ 4.82
LDB1-204	ENST00000490751	ARHGEF10	O15013	1369 aa		45.13	■■■■■ 4.82
LDB1-204	ENST00000490751	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		45.12	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	45.12	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	CDK19	Q9BWU1	502 aa		45.12	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	ABCA3	Q99758	1704 aa		45.12	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	45.09	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	45.09	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	45.08	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	RGS12	O14924	1447 aa		45.08	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		45.07	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	ALS2	Q96Q42	1657 aa		45.07	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		45.07	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	PLEKHG5	O94827	1062 aa		45.07	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	45.07	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		45.07	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	ATRN	O75882	1429 aa		45.07	■■■■■ 4.81
LDB1-204	ENST00000490751	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		45.06	■■■■■ 4.8
LDB1-204	ENST00000490751	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	45.01	■■■■■ 4.8
LDB1-204	ENST00000490751	SLIT2	O94813	1529 aa		44.99	■■■■■ 4.79
LDB1-204	ENST00000490751	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	44.98	■■■■■ 4.79
LDB1-204	ENST00000490751	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		44.96	■■■■■ 4.79
LDB1-204	ENST00000490751	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	44.94	■■■■■ 4.78
LDB1-204	ENST00000490751	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		44.93	■■■■■ 4.78
LDB1-204	ENST00000490751	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	44.92	■■■■■ 4.78
LDB1-204	ENST00000490751	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		44.92	■■■■■ 4.78
LDB1-204	ENST00000490751	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		44.91	■■■■■ 4.78
LDB1-204	ENST00000490751	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	44.91	■■■■■ 4.78

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