RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487163.5

USP21-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP21, Length 2,514 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-208ENST00000487163 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.05■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 EVC2Q86UK5 1308 aa22.05■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.04■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 SHPRHQ149N8 1683 aa22.02■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.02■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.02■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.02■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.02■■□□□ 1.11
USP21-208ENST00000487163 NEUROD2Q15784 382 aa22.02■■□□□ 1.11
USP21-208ENST00000487163 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.01■■□□□ 1.11
USP21-208ENST00000487163 MTHFSP49914 203 aa22.01■■□□□ 1.11
USP21-208ENST00000487163 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
USP21-208ENST00000487163 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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USP21-208ENST00000487163 BCAR3O75815 825 aa22■■□□□ 1.11
USP21-208ENST00000487163 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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USP21-208ENST00000487163 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-208ENST00000487163 TSPOAP1O95153 1857 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-208ENST00000487163 PDE4AP27815 886 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-208ENST00000487163 WWC1Q8IX03 1113 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-208ENST00000487163 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
USP21-208ENST00000487163 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
USP21-208ENST00000487163 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.98■■□□□ 1.11
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USP21-208ENST00000487163 USP32Q8NFA0 1604 aa21.96■■□□□ 1.11
USP21-208ENST00000487163 ZFYVE9O95405 1425 aa21.96■■□□□ 1.11
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USP21-208ENST00000487163 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
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USP21-208ENST00000487163 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.94■■□□□ 1.1
USP21-208ENST00000487163 RUNDC1Q96C34 613 aa21.94■■□□□ 1.1
USP21-208ENST00000487163 PRAM1Q96QH2 718 aa21.94■■□□□ 1.1
USP21-208ENST00000487163 BACH2Q9BYV9 841 aa21.94■■□□□ 1.1
USP21-208ENST00000487163 NGEFQ8N5V2 710 aa21.93■■□□□ 1.1
USP21-208ENST00000487163 MS4A1P11836 297 aa21.92■■□□□ 1.1
USP21-208ENST00000487163 A0A1W2PP64 1363 aa21.92■■□□□ 1.1
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USP21-208ENST00000487163 PTPRMP28827 1452 aa21.91■■□□□ 1.1
USP21-208ENST00000487163 CFAP53Q96M91 514 aa21.91■■□□□ 1.1
USP21-208ENST00000487163 DIP2BQ9P265 1576 aa21.91■■□□□ 1.1
USP21-208ENST00000487163 POGKQ9P215 609 aa21.9■■□□□ 1.1
USP21-208ENST00000487163 MLECQ14165 292 aa21.9■■□□□ 1.1
USP21-208ENST00000487163 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.89■■□□□ 1.1
USP21-208ENST00000487163 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
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USP21-208ENST00000487163 NSD2O96028 1365 aa21.87■■□□□ 1.09
USP21-208ENST00000487163 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
USP21-208ENST00000487163 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
USP21-208ENST00000487163 ABCC11Q96J66 1382 aa21.86■■□□□ 1.09
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USP21-208ENST00000487163 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
USP21-208ENST00000487163 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.81■■□□□ 1.08
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USP21-208ENST00000487163 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.81■■□□□ 1.08
USP21-208ENST00000487163 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.81■■□□□ 1.08
USP21-208ENST00000487163 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
USP21-208ENST00000487163 NBR1Q14596 966 aa21.8■■□□□ 1.08
USP21-208ENST00000487163 COG6Q9Y2V7 657 aa21.8■■□□□ 1.08
USP21-208ENST00000487163 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.79■■□□□ 1.08
USP21-208ENST00000487163 WDR63Q8IWG1 891 aa21.79■■□□□ 1.08
USP21-208ENST00000487163 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.79■■□□□ 1.08
USP21-208ENST00000487163 CABP1Q9NZU7 370 aa21.79■■□□□ 1.08
USP21-208ENST00000487163 RGS3P49796 1198 aa21.78■■□□□ 1.08
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USP21-208ENST00000487163 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.77■■□□□ 1.08
USP21-208ENST00000487163 IGHDP01880 384 aa21.76■■□□□ 1.07
USP21-208ENST00000487163 TNNQ9UQP3 1299 aa21.76■■□□□ 1.07
USP21-208ENST00000487163 AGLP35573 1532 aa21.76■■□□□ 1.07
USP21-208ENST00000487163 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.76■■□□□ 1.07
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USP21-208ENST00000487163 NLRP1Q9C000 1473 aa21.75■■□□□ 1.07
USP21-208ENST00000487163 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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USP21-208ENST00000487163 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
USP21-208ENST00000487163 FBLN1P23142 703 aa21.73■■□□□ 1.07
USP21-208ENST00000487163 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
USP21-208ENST00000487163 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.73■■□□□ 1.07
USP21-208ENST00000487163 ADGRB2O60241 1585 aa21.73■■□□□ 1.07
USP21-208ENST00000487163 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.73■■□□□ 1.07
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USP21-208ENST00000487163 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.72■■□□□ 1.07
USP21-208ENST00000487163 RLBP1P12271 317 aa21.72■■□□□ 1.07
USP21-208ENST00000487163 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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