RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481600.5

EDRF1-208, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene EDRF1, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-208ENST00000481600 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
EDRF1-208ENST00000481600 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.79□□□□□ -0.04
EDRF1-208ENST00000481600 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
EDRF1-208ENST00000481600 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
EDRF1-208ENST00000481600 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.78□□□□□ -0.04
EDRF1-208ENST00000481600 SLC4A3P48751 1232 aa14.77□□□□□ -0.04
EDRF1-208ENST00000481600 PDE3AQ14432 1141 aa14.77□□□□□ -0.04
EDRF1-208ENST00000481600 HSCBQ8IWL3 235 aa14.77□□□□□ -0.04
EDRF1-208ENST00000481600 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.77□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.77□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 ERVK-7P63135 1459 aa14.76□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 MYOM2P54296 1465 aa14.76□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 PLCB2Q00722 1185 aa14.76□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 WWC1Q8IX03 1113 aa14.76□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 RUNDC1Q96C34 613 aa14.76□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 MLECQ14165 292 aa14.75□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.75□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 COG6Q9Y2V7 657 aa14.75□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 C8orf34Q49A92 452 aa14.74□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 NSD3Q9BZ95 1437 aa14.74□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 APBB1O00213 710 aa14.74□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.74□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 NOS1P29475 1434 aa14.74□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.74□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 DEPDC5O75140 1603 aa14.73□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.73□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 PANK1Q8TE04 598 aa14.73□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.73□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.73□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 NFKBIBQ15653 356 aa14.72□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.72□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.72□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.71□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.71□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.71□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
EDRF1-208ENST00000481600 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.71□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 MTHFSP49914 203 aa14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 KIF1BO60333 1816 aa14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 MYOM1P52179 1685 aa14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 ABCA6Q8N139 1617 aa14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 AAMPQ13685 434 aa14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.69□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 EVC2Q86UK5 1308 aa14.69□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 IGHDP01880 384 aa14.69□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 WDR63Q8IWG1 891 aa14.69□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 ASXL2Q76L83 1435 aa14.68□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 KCNJ4P48050 445 aa14.68□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.68□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 GSE1Q14687 1217 aa14.67□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.67□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.67□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.67□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.66□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.66□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.66□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 FGD1P98174 961 aa14.65□□□□□ -0.06
EDRF1-208ENST00000481600 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.63□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 CCDC27Q2M243 656 aa14.62□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.62□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.62□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.62□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 CABP2Q9NPB3 220 aa14.62□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 NPATQ14207 1427 aa14.62□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.61□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.61□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 NSD2O96028 1365 aa14.61□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 CD109Q6YHK3 1445 aa14.6□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 ADGRB3O60242 1522 aa14.6□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.6□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.59□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.58□□□□□ -0.07
EDRF1-208ENST00000481600 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.58□□□□□ -0.08
EDRF1-208ENST00000481600 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106 ms