RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428818.5

TTC28-AS1-208, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene TTC28-AS1, Length 706 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TMEM94Q12767 1356 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TBX22Q9Y458 520 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PIK3R4Q99570 1358 aa13.77□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa13.76□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PTCH1Q13635 1447 aa13.76□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PRAG1Q86YV5 1406 aa13.76□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ROBO2Q9HCK4 1378 aa13.76□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa13.75□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NEUROD1Q13562 356 aa13.74□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DCAF11Q8TEB1 546 aa13.74□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.74□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa13.73□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.73□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.73□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.73□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FMN2Q9NZ56 1722 aa13.73□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TECPR2O15040 1411 aa13.73□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FBXO41Q8TF61 875 aa13.72□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa13.71□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 QRICH2Q9H0J4 1663 aa13.71□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa13.71□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.7□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PROM2Q8N271 834 aa13.7□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 L3MBTL2Q969R5 705 aa13.7□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DLC1Q96QB1 1528 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 STK26Q9P289 416 aa13.69□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 USP32Q8NFA0 1604 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PHLPP1O60346 1717 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ADGRB2O60241 1585 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NHSL1Q5SYE7 1610 aa13.68□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PIP4K2BP78356 416 aa13.67□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MSH6P52701 1360 aa13.67□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HAX1O00165 279 aa13.66□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MST1RQ04912 1400 aa13.65□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 WAPLQ7Z5K2 1190 aa13.65□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RALGAPBQ86X10 1494 aa13.64□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TONSLQ96HA7 1378 aa13.64□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ABCC11Q96J66 1382 aa13.64□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NBPF1Q3BBV0 1214 aa13.64□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NBPF8Q3BBV2 869 aa13.64□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DCCP43146 1447 aa13.64□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.64□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa13.63□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C14orf37Q86TY3 774 aa13.63□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP13.62□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FAM135BQ49AJ0 1406 aa13.62□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ITSN1Q15811 1721 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C1orf167Q5SNV9 1468 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TULP4Q9NRJ4 1543 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TOM1O60784 492 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PRAM1Q96QH2 718 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HSPA1LP34931 641 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KIF1AQ12756 1690 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GPRASP1Q5JY77 1395 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C19orf44Q9H6X5 657 aa13.56□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SHPRHQ149N8 1683 aa13.56□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NUTM2FA1L443 756 aa13.55□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ATP7BP35670 1465 aa13.55□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ABCA3Q99758 1704 aa13.54□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ATF3P18847 181 aa13.54□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SLAIN2Q9P270 581 aa13.54□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 BRINP3Q76B58 766 aa13.53□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CADPS2Q86UW7 1296 aa13.53□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 STAC3Q96MF2 364 aa13.53□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CLSPNQ9HAW4 1339 aa13.52□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PXDNQ92626 1479 aa13.51□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PRR36Q9H6K5 1346 aa13.51□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 EVX2Q03828 476 aa13.51□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ORAI2Q96SN7 254 aa13.51□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 POGKQ9P215 609 aa13.51□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 AKAP12Q02952 1782 aa13.5□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa13.5□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SIRT1Q96EB6 747 aa13.49□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ALS2Q96Q42 1657 aa13.49□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LRP6O75581 1613 aa13.49□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms