RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 RPIAP49247 311 aa10.24□□□□□ -0.77
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PTPRK-209ENST00000415046 TRAF7Q6Q0C0 670 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-209ENST00000415046 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-209ENST00000415046 MMP16P51512 607 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-209ENST00000415046 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
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PTPRK-209ENST00000415046 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
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PTPRK-209ENST00000415046 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-209ENST00000415046 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.08□□□□□ -0.8
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PTPRK-209ENST00000415046 SPTLC1O15269 473 aa10.03□□□□□ -0.8
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PTPRK-209ENST00000415046 SLC24A1O60721 1099 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRK-209ENST00000415046 CCNYL3P0C7X3 344 aa10.02□□□□□ -0.81
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PTPRK-209ENST00000415046 BCANQ96GW7 911 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRK-209ENST00000415046 AVPP01185 164 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-209ENST00000415046 SKOR1P84550 965 aa10.01□□□□□ -0.81
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PTPRK-209ENST00000415046 AAASQ9NRG9 546 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-209ENST00000415046 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-209ENST00000415046 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF787Q6DD87 383 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-209ENST00000415046 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-209ENST00000415046 ST8SIA5O15466 376 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-209ENST00000415046 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-209ENST00000415046 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
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PTPRK-209ENST00000415046 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-209ENST00000415046 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-209ENST00000415046 SMPD1P17405 629 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRK-209ENST00000415046 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.97□□□□□ -0.81
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PTPRK-209ENST00000415046 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.96□□□□□ -0.82
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PTPRK-209ENST00000415046 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRK-209ENST00000415046 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.95□□□□□ -0.82
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PTPRK-209ENST00000415046 J3QL48 77 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRK-209ENST00000415046 LYPD8Q6UX82 237 aa9.93□□□□□ -0.82
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PTPRK-209ENST00000415046 SH3BP2P78314 561 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRK-209ENST00000415046 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRK-209ENST00000415046 QPCTQ16769 361 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRK-209ENST00000415046 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRK-209ENST00000415046 SIAH2O43255 324 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRK-209ENST00000415046 LILRB3O75022 631 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRK-209ENST00000415046 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRK-209ENST00000415046 DACH1Q9UI36 760 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRK-209ENST00000415046 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-209ENST00000415046 LINC01559Q495D7 138 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF511Q8NB15 262 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-209ENST00000415046 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-209ENST00000415046 BAP1Q92560 729 aa9.88□□□□□ -0.83
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