RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU2-38P-201ENST00000410856 GCGRP47871 477 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRIM32Q13049 653 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU2-38P-201ENST00000410856 BRICD5Q6PL45 260 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU2-38P-201ENST00000410856 GNPATO15228 680 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU2-38P-201ENST00000410856 SMPD1P17405 629 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU2-38P-201ENST00000410856 SEMA3EO15041 775 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q3C1V9 767 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 FECHP22830 423 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 MMP16P51512 607 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 J3QL48 77 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 WNT7BP56706 349 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 LCE2CQ5TA81 110 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 HPS1Q92902 700 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPR37O15354 613 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 NLRP7Q8WX94 980 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 IRF7Q92985 503 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 KDM4AO75164 1064 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 ALDH1A1P00352 501 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 CD46P15529 392 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 USP46P62068 366 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 PHOX2BQ99453 314 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 SKOR1P84550 965 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU2-38P-201ENST00000410856 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU2-38P-201ENST00000410856 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU2-38P-201ENST00000410856 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU2-38P-201ENST00000410856 GMPRP36959 345 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU2-38P-201ENST00000410856 H3BM21 787 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU2-38P-201ENST00000410856 BMP1P13497 986 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU2-38P-201ENST00000410856 JUNDP17535 347 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU2-38P-201ENST00000410856 HOXA2O43364 376 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU2-38P-201ENST00000410856 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU2-38P-201ENST00000410856 SIAH2O43255 324 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAP2K5Q13163 448 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU2-38P-201ENST00000410856 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 RETREG3Q86VR2 466 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 HLA-CQ95604 372 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 VEGFBP49765 207 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZFP42Q96MM3 310 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 ERBB4Q15303 1308 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 SCARF1Q14162 830 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 MS4A1P11836 297 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 SH3BP2P78314 561 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 GUCA2AQ02747 115 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 VSIG8P0DPA2 414 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 NNTQ13423 1086 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 PTPRNQ16849 979 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU2-38P-201ENST00000410856 IRF6O14896 467 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 ADH1CP00326 375 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 CLCN1P35523 988 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 MPNDQ8N594 471 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 C6orf229H3BNL8 230 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 FDX1P10109 184 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF511Q8NB15 262 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 TIMP2P16035 220 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 LINC01559Q495D7 138 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNH2Q12809 1159 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC102AQ96A19 550 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAN1A2O60476 641 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNMA1Q12791 1236 aa6.47□□□□□ -1.37
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