RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 ILDR2Q71H61 639 aa23.91■■□□□ 1.42
NME1-NME2-202ENST00000393193 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.91■■□□□ 1.42
NME1-NME2-202ENST00000393193 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.9■■□□□ 1.42
NME1-NME2-202ENST00000393193 STK26Q9P289 416 aa23.9■■□□□ 1.42
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADGRB2O60241 1585 aa23.88■■□□□ 1.41
NME1-NME2-202ENST00000393193 JCADQ9P266 1359 aa23.88■■□□□ 1.41
NME1-NME2-202ENST00000393193 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRP6O75581 1613 aa23.84■■□□□ 1.41
NME1-NME2-202ENST00000393193 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.84■■□□□ 1.41
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP32Q8NFA0 1604 aa23.83■■□□□ 1.41
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 ORAI2Q96SN7 254 aa23.82■■□□□ 1.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 PXDNQ92626 1479 aa23.79■■□□□ 1.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRAM1Q96QH2 718 aa23.78■■□□□ 1.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF1AQ12756 1690 aa23.78■■□□□ 1.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.77■■□□□ 1.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.76■■□□□ 1.39
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.75■■□□□ 1.39
NME1-NME2-202ENST00000393193 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.75■■□□□ 1.39
NME1-NME2-202ENST00000393193 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.74■■□□□ 1.39
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.72■■□□□ 1.39
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.69■■□□□ 1.38
NME1-NME2-202ENST00000393193 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.69■■□□□ 1.38
NME1-NME2-202ENST00000393193 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
NME1-NME2-202ENST00000393193 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.68■■□□□ 1.38
NME1-NME2-202ENST00000393193 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.68■■□□□ 1.38
NME1-NME2-202ENST00000393193 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.66■■□□□ 1.38
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUTM2FA1L443 756 aa23.66■■□□□ 1.38
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
NME1-NME2-202ENST00000393193 POGKQ9P215 609 aa23.65■■□□□ 1.38
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.64■■□□□ 1.38
NME1-NME2-202ENST00000393193 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.64■■□□□ 1.38
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATP7BP35670 1465 aa23.63■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 ITSN1Q15811 1721 aa23.63■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 FOXO3O43524 673 aa23.62■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 POTEAQ6S8J7 498 aa23.62■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.62■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 SOCS7O14512 581 aa23.61■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 NEUROD1Q13562 356 aa23.6■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCA3Q99758 1704 aa23.59■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.59■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 ALS2Q96Q42 1657 aa23.58■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.58■■□□□ 1.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.57■■□□□ 1.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.56■■□□□ 1.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.54■■□□□ 1.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.54■■□□□ 1.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 SBNO1A3KN83 1393 aa23.53■■□□□ 1.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.52■■□□□ 1.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.52■■□□□ 1.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
NME1-NME2-202ENST00000393193 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.49■■□□□ 1.35
NME1-NME2-202ENST00000393193 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDK19Q9BWU1 502 aa23.48■■□□□ 1.35
NME1-NME2-202ENST00000393193 AFF2P51816 1311 aa23.48■■□□□ 1.35
NME1-NME2-202ENST00000393193 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NME1-NME2-202ENST00000393193 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NME1-NME2-202ENST00000393193 TONSLQ96HA7 1378 aa23.46■■□□□ 1.35
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADAMTS2O95450 1211 aa23.43■■□□□ 1.34
NME1-NME2-202ENST00000393193 PSME1Q06323 249 aa23.43■■□□□ 1.34
NME1-NME2-202ENST00000393193 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARHGEF10O15013 1369 aa23.42■■□□□ 1.34
NME1-NME2-202ENST00000393193 C8orf37Q96NL8 207 aa23.42■■□□□ 1.34
NME1-NME2-202ENST00000393193 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.42■■□□□ 1.34
NME1-NME2-202ENST00000393193 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.41■■□□□ 1.34
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.41■■□□□ 1.34
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLIT2O94813 1529 aa23.41■■□□□ 1.34
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.41■■□□□ 1.34
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.4■■□□□ 1.34
NME1-NME2-202ENST00000393193 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.39■■□□□ 1.33
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATRNO75882 1429 aa23.38■■□□□ 1.33
NME1-NME2-202ENST00000393193 AKAP12Q02952 1782 aa23.37■■□□□ 1.33
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.36■■□□□ 1.33
NME1-NME2-202ENST00000393193 NGLY1Q96IV0 654 aa23.36■■□□□ 1.33
NME1-NME2-202ENST00000393193 NRAPQ86VF7 1730 aa23.36■■□□□ 1.33
NME1-NME2-202ENST00000393193 ACEP12821 1306 aa23.35■■□□□ 1.33
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.35■■□□□ 1.33
NME1-NME2-202ENST00000393193 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.35■■□□□ 1.33
NME1-NME2-202ENST00000393193 CABP2Q9NPB3 220 aa23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms