RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 LAMC1P11047 1609 aa29.68■■■□□ 2.34
PITX3-201ENST00000370002 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.66■■■□□ 2.34
PITX3-201ENST00000370002 ORAI2Q96SN7 254 aa29.66■■■□□ 2.34
PITX3-201ENST00000370002 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.66■■■□□ 2.34
PITX3-201ENST00000370002 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
PITX3-201ENST00000370002 SHPRHQ149N8 1683 aa29.65■■■□□ 2.34
PITX3-201ENST00000370002 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.64■■■□□ 2.34
PITX3-201ENST00000370002 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.61■■■□□ 2.33
PITX3-201ENST00000370002 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.61■■■□□ 2.33
PITX3-201ENST00000370002 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.61■■■□□ 2.33
PITX3-201ENST00000370002 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
PITX3-201ENST00000370002 LRP6O75581 1613 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX3-201ENST00000370002 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
PITX3-201ENST00000370002 POTEAQ6S8J7 498 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX3-201ENST00000370002 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
PITX3-201ENST00000370002 DLC1Q96QB1 1528 aa29.58■■■□□ 2.33
PITX3-201ENST00000370002 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.58■■■□□ 2.33
PITX3-201ENST00000370002 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.58■■■□□ 2.33
PITX3-201ENST00000370002 ADGRB1O14514 1584 aa29.55■■■□□ 2.32
PITX3-201ENST00000370002 PRAM1Q96QH2 718 aa29.55■■■□□ 2.32
PITX3-201ENST00000370002 POGKQ9P215 609 aa29.52■■■□□ 2.32
PITX3-201ENST00000370002 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
PITX3-201ENST00000370002 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
PITX3-201ENST00000370002 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
PITX3-201ENST00000370002 FOXO3O43524 673 aa29.5■■■□□ 2.31
PITX3-201ENST00000370002 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.47■■■□□ 2.31
PITX3-201ENST00000370002 NUTM2FA1L443 756 aa29.45■■■□□ 2.31
PITX3-201ENST00000370002 PXDNQ92626 1479 aa29.45■■■□□ 2.3
PITX3-201ENST00000370002 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.44■■■□□ 2.3
PITX3-201ENST00000370002 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
PITX3-201ENST00000370002 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.42■■■□□ 2.3
PITX3-201ENST00000370002 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
PITX3-201ENST00000370002 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.42■■■□□ 2.3
PITX3-201ENST00000370002 AFF2P51816 1311 aa29.4■■■□□ 2.3
PITX3-201ENST00000370002 ADGRB2O60241 1585 aa29.4■■■□□ 2.3
PITX3-201ENST00000370002 PSME1Q06323 249 aa29.39■■■□□ 2.3
PITX3-201ENST00000370002 KIF1AQ12756 1690 aa29.38■■■□□ 2.29
PITX3-201ENST00000370002 C8orf37Q96NL8 207 aa29.38■■■□□ 2.29
PITX3-201ENST00000370002 RXRBP28702 533 aa29.37■■■□□ 2.29
PITX3-201ENST00000370002 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.37■■■□□ 2.29
PITX3-201ENST00000370002 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.37■■■□□ 2.29
PITX3-201ENST00000370002 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
PITX3-201ENST00000370002 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
PITX3-201ENST00000370002 NGLY1Q96IV0 654 aa29.35■■■□□ 2.29
PITX3-201ENST00000370002 ADAMTS2O95450 1211 aa29.34■■■□□ 2.29
PITX3-201ENST00000370002 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
PITX3-201ENST00000370002 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
PITX3-201ENST00000370002 SBNO1A3KN83 1393 aa29.32■■■□□ 2.28
PITX3-201ENST00000370002 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
PITX3-201ENST00000370002 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
PITX3-201ENST00000370002 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
PITX3-201ENST00000370002 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.31■■■□□ 2.28
PITX3-201ENST00000370002 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
PITX3-201ENST00000370002 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.29■■■□□ 2.28
PITX3-201ENST00000370002 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
PITX3-201ENST00000370002 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.27■■■□□ 2.28
PITX3-201ENST00000370002 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.26■■■□□ 2.27
PITX3-201ENST00000370002 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.26■■■□□ 2.27
PITX3-201ENST00000370002 USP21Q9UK80 565 aa29.26■■■□□ 2.27
PITX3-201ENST00000370002 ARHGEF10O15013 1369 aa29.25■■■□□ 2.27
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PITX3-201ENST00000370002 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.24■■■□□ 2.27
PITX3-201ENST00000370002 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.24■■■□□ 2.27
PITX3-201ENST00000370002 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.24■■■□□ 2.27
PITX3-201ENST00000370002 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
PITX3-201ENST00000370002 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.23■■■□□ 2.27
PITX3-201ENST00000370002 USP32Q8NFA0 1604 aa29.21■■■□□ 2.27
PITX3-201ENST00000370002 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
PITX3-201ENST00000370002 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
PITX3-201ENST00000370002 CDK19Q9BWU1 502 aa29.18■■■□□ 2.26
PITX3-201ENST00000370002 NEUROD1Q13562 356 aa29.17■■■□□ 2.26
PITX3-201ENST00000370002 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
PITX3-201ENST00000370002 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.17■■■□□ 2.26
PITX3-201ENST00000370002 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PITX3-201ENST00000370002 ATRNO75882 1429 aa29.15■■■□□ 2.26
PITX3-201ENST00000370002 ATP7BP35670 1465 aa29.14■■■□□ 2.26
PITX3-201ENST00000370002 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.14■■■□□ 2.26
PITX3-201ENST00000370002 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
PITX3-201ENST00000370002 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
PITX3-201ENST00000370002 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.12■■■□□ 2.25
PITX3-201ENST00000370002 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.12■■■□□ 2.25
PITX3-201ENST00000370002 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.11■■■□□ 2.25
PITX3-201ENST00000370002 SLIT2O94813 1529 aa29.1■■■□□ 2.25
PITX3-201ENST00000370002 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
PITX3-201ENST00000370002 RGS12O14924 1447 aa29.08■■■□□ 2.25
PITX3-201ENST00000370002 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
PITX3-201ENST00000370002 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PITX3-201ENST00000370002 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
PITX3-201ENST00000370002 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.06■■■□□ 2.24
PITX3-201ENST00000370002 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.04■■■□□ 2.24
PITX3-201ENST00000370002 ACEP12821 1306 aa29.03■■■□□ 2.24
PITX3-201ENST00000370002 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
PITX3-201ENST00000370002 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
PITX3-201ENST00000370002 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
PITX3-201ENST00000370002 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PITX3-201ENST00000370002 ITSN1Q15811 1721 aa29.02■■■□□ 2.24
PITX3-201ENST00000370002 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.24
PITX3-201ENST00000370002 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29■■■□□ 2.23
PITX3-201ENST00000370002 EVC2Q86UK5 1308 aa29■■■□□ 2.23
PITX3-201ENST00000370002 VPS72Q15906 364 aa29■■■□□ 2.23
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