RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345348.9

TM7SF2-202, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF2, Length 1,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF2-202ENST00000345348 POGKQ9P215 609 aa28.46■■■□□ 2.15
TM7SF2-202ENST00000345348 ATF3P18847 181 aa28.45■■■□□ 2.14
TM7SF2-202ENST00000345348 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.44■■■□□ 2.14
TM7SF2-202ENST00000345348 DCCP43146 1447 aa28.44■■■□□ 2.14
TM7SF2-202ENST00000345348 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.43■■■□□ 2.14
TM7SF2-202ENST00000345348 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.43■■■□□ 2.14
TM7SF2-202ENST00000345348 PIP4K2BP78356 416 aa28.4■■■□□ 2.14
TM7SF2-202ENST00000345348 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.4■■■□□ 2.14
TM7SF2-202ENST00000345348 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
TM7SF2-202ENST00000345348 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.38■■■□□ 2.13
TM7SF2-202ENST00000345348 SLAIN2Q9P270 581 aa28.37■■■□□ 2.13
TM7SF2-202ENST00000345348 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
TM7SF2-202ENST00000345348 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TM7SF2-202ENST00000345348 MST1RQ04912 1400 aa28.32■■■□□ 2.12
TM7SF2-202ENST00000345348 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
TM7SF2-202ENST00000345348 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.32■■■□□ 2.12
TM7SF2-202ENST00000345348 ADGRB2O60241 1585 aa28.32■■■□□ 2.12
TM7SF2-202ENST00000345348 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
TM7SF2-202ENST00000345348 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.31■■■□□ 2.12
TM7SF2-202ENST00000345348 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.3■■■□□ 2.12
TM7SF2-202ENST00000345348 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TM7SF2-202ENST00000345348 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.27■■■□□ 2.12
TM7SF2-202ENST00000345348 NUTM2FA1L443 756 aa28.25■■■□□ 2.11
TM7SF2-202ENST00000345348 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
TM7SF2-202ENST00000345348 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
TM7SF2-202ENST00000345348 BRINP3Q76B58 766 aa28.21■■■□□ 2.11
TM7SF2-202ENST00000345348 USP47Q96K76 1375 aa28.19■■■□□ 2.1
TM7SF2-202ENST00000345348 ORAI2Q96SN7 254 aa28.18■■■□□ 2.1
TM7SF2-202ENST00000345348 USP32Q8NFA0 1604 aa28.17■■■□□ 2.1
TM7SF2-202ENST00000345348 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.17■■■□□ 2.1
TM7SF2-202ENST00000345348 CDK19Q9BWU1 502 aa28.17■■■□□ 2.1
TM7SF2-202ENST00000345348 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.17■■■□□ 2.1
TM7SF2-202ENST00000345348 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.16■■■□□ 2.1
TM7SF2-202ENST00000345348 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.15■■■□□ 2.1
TM7SF2-202ENST00000345348 HSPA1LP34931 641 aa28.15■■■□□ 2.1
TM7SF2-202ENST00000345348 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.15■■■□□ 2.1
TM7SF2-202ENST00000345348 PHLPP1O60346 1717 aa28.14■■■□□ 2.09
TM7SF2-202ENST00000345348 EVC2Q86UK5 1308 aa28.13■■■□□ 2.09
TM7SF2-202ENST00000345348 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.12■■■□□ 2.09
TM7SF2-202ENST00000345348 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.11■■■□□ 2.09
TM7SF2-202ENST00000345348 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
TM7SF2-202ENST00000345348 ITSN1Q15811 1721 aa28.11■■■□□ 2.09
TM7SF2-202ENST00000345348 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TM7SF2-202ENST00000345348 KIF1AQ12756 1690 aa28.11■■■□□ 2.09
TM7SF2-202ENST00000345348 ATP7BP35670 1465 aa28.1■■■□□ 2.09
TM7SF2-202ENST00000345348 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TM7SF2-202ENST00000345348 CABP2Q9NPB3 220 aa28.08■■■□□ 2.09
TM7SF2-202ENST00000345348 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
TM7SF2-202ENST00000345348 TESK2Q96S53 571 aa28.08■■■□□ 2.09
TM7SF2-202ENST00000345348 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.08■■■□□ 2.09
TM7SF2-202ENST00000345348 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.06■■■□□ 2.08
TM7SF2-202ENST00000345348 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.08
TM7SF2-202ENST00000345348 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
TM7SF2-202ENST00000345348 FOXO3O43524 673 aa28.04■■■□□ 2.08
TM7SF2-202ENST00000345348 SLC24A1O60721 1099 aa28.04■■■□□ 2.08
TM7SF2-202ENST00000345348 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.04■■■□□ 2.08
TM7SF2-202ENST00000345348 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.03■■■□□ 2.08
TM7SF2-202ENST00000345348 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.03■■■□□ 2.08
TM7SF2-202ENST00000345348 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TM7SF2-202ENST00000345348 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.98■■■□□ 2.07
TM7SF2-202ENST00000345348 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
TM7SF2-202ENST00000345348 TMF1P82094 1093 aa27.98■■■□□ 2.07
TM7SF2-202ENST00000345348 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.97■■■□□ 2.07
TM7SF2-202ENST00000345348 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
TM7SF2-202ENST00000345348 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
TM7SF2-202ENST00000345348 PXDNQ92626 1479 aa27.97■■■□□ 2.07
TM7SF2-202ENST00000345348 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.96■■■□□ 2.07
TM7SF2-202ENST00000345348 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.95■■■□□ 2.06
TM7SF2-202ENST00000345348 PSME1Q06323 249 aa27.95■■■□□ 2.06
TM7SF2-202ENST00000345348 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.94■■■□□ 2.06
TM7SF2-202ENST00000345348 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
TM7SF2-202ENST00000345348 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
TM7SF2-202ENST00000345348 CABP1Q9NZU7 370 aa27.94■■■□□ 2.06
TM7SF2-202ENST00000345348 ACEP12821 1306 aa27.92■■■□□ 2.06
TM7SF2-202ENST00000345348 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
TM7SF2-202ENST00000345348 JCADQ9P266 1359 aa27.91■■■□□ 2.06
TM7SF2-202ENST00000345348 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
TM7SF2-202ENST00000345348 SHPRHQ149N8 1683 aa27.9■■■□□ 2.06
TM7SF2-202ENST00000345348 CDCA8Q53HL2 280 aa27.89■■■□□ 2.05
TM7SF2-202ENST00000345348 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TM7SF2-202ENST00000345348 TMC1Q8TDI8 760 aa27.87■■■□□ 2.05
TM7SF2-202ENST00000345348 AKAP12Q02952 1782 aa27.86■■■□□ 2.05
TM7SF2-202ENST00000345348 SBNO1A3KN83 1393 aa27.85■■■□□ 2.05
TM7SF2-202ENST00000345348 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.84■■■□□ 2.05
TM7SF2-202ENST00000345348 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.84■■■□□ 2.05
TM7SF2-202ENST00000345348 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.83■■■□□ 2.05
TM7SF2-202ENST00000345348 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.83■■■□□ 2.04
TM7SF2-202ENST00000345348 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.81■■■□□ 2.04
TM7SF2-202ENST00000345348 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TM7SF2-202ENST00000345348 ALS2Q96Q42 1657 aa27.8■■■□□ 2.04
TM7SF2-202ENST00000345348 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
TM7SF2-202ENST00000345348 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.79■■■□□ 2.04
TM7SF2-202ENST00000345348 USP6P35125 1406 aa27.79■■■□□ 2.04
TM7SF2-202ENST00000345348 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
TM7SF2-202ENST00000345348 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
TM7SF2-202ENST00000345348 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.78■■■□□ 2.04
TM7SF2-202ENST00000345348 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.78■■■□□ 2.04
TM7SF2-202ENST00000345348 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.77■■■□□ 2.04
TM7SF2-202ENST00000345348 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.77■■■□□ 2.04
TM7SF2-202ENST00000345348 MYOM1P52179 1685 aa27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms