RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 PTPRMP28827 1452 aa27.38■■□□□ 1.97
KCNQ1-202ENST00000335475 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
KCNQ1-202ENST00000335475 EVC2Q86UK5 1308 aa27.38■■□□□ 1.97
KCNQ1-202ENST00000335475 SLFN5Q08AF3 891 aa27.37■■□□□ 1.97
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.37■■□□□ 1.97
KCNQ1-202ENST00000335475 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
KCNQ1-202ENST00000335475 APAF1O14727 1248 aa27.35■■□□□ 1.97
KCNQ1-202ENST00000335475 CRBNQ96SW2 442 aa27.33■■□□□ 1.97
KCNQ1-202ENST00000335475 MORC1Q86VD1 984 aa27.32■■□□□ 1.96
KCNQ1-202ENST00000335475 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.31■■□□□ 1.96
KCNQ1-202ENST00000335475 NSD2O96028 1365 aa27.31■■□□□ 1.96
KCNQ1-202ENST00000335475 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.31■■□□□ 1.96
KCNQ1-202ENST00000335475 ALKQ9UM73 1620 aa27.31■■□□□ 1.96
KCNQ1-202ENST00000335475 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
KCNQ1-202ENST00000335475 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.3■■□□□ 1.96
KCNQ1-202ENST00000335475 NGEFQ8N5V2 710 aa27.3■■□□□ 1.96
KCNQ1-202ENST00000335475 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
KCNQ1-202ENST00000335475 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
KCNQ1-202ENST00000335475 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.29■■□□□ 1.96
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KCNQ1-202ENST00000335475 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.28■■□□□ 1.96
KCNQ1-202ENST00000335475 CABP2Q9NPB3 220 aa27.26■■□□□ 1.96
KCNQ1-202ENST00000335475 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.25■■□□□ 1.95
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.25■■□□□ 1.95
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.25■■□□□ 1.95
KCNQ1-202ENST00000335475 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.25■■□□□ 1.95
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1W2PP64 1363 aa27.24■■□□□ 1.95
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCC11Q96J66 1382 aa27.24■■□□□ 1.95
KCNQ1-202ENST00000335475 E9PSI1 815 aa27.23■■□□□ 1.95
KCNQ1-202ENST00000335475 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.23■■□□□ 1.95
KCNQ1-202ENST00000335475 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
KCNQ1-202ENST00000335475 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
KCNQ1-202ENST00000335475 STK26Q9P289 416 aa27.22■■□□□ 1.95
KCNQ1-202ENST00000335475 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.22■■□□□ 1.95
KCNQ1-202ENST00000335475 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.21■■□□□ 1.95
KCNQ1-202ENST00000335475 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.2■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 MTHFSP49914 203 aa27.19■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 ADGRB2O60241 1585 aa27.18■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 WWC1Q8IX03 1113 aa27.18■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 DLC1Q96QB1 1528 aa27.18■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 NLRP1Q9C000 1473 aa27.18■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 PRAM1Q96QH2 718 aa27.17■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 RUNDC1Q96C34 613 aa27.16■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27.16■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 MED14O60244 1454 aa27.16■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
KCNQ1-202ENST00000335475 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
KCNQ1-202ENST00000335475 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.14■■□□□ 1.93
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KCNQ1-202ENST00000335475 MS4A1P11836 297 aa27.12■■□□□ 1.93
KCNQ1-202ENST00000335475 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.12■■□□□ 1.93
KCNQ1-202ENST00000335475 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.12■■□□□ 1.93
KCNQ1-202ENST00000335475 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.1■■□□□ 1.93
KCNQ1-202ENST00000335475 POGKQ9P215 609 aa27.09■■□□□ 1.93
KCNQ1-202ENST00000335475 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.09■■□□□ 1.93
KCNQ1-202ENST00000335475 BCAR3O75815 825 aa27.08■■□□□ 1.93
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC27Q2M243 656 aa27.06■■□□□ 1.92
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KCNQ1-202ENST00000335475 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
KCNQ1-202ENST00000335475 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.05■■□□□ 1.92
KCNQ1-202ENST00000335475 PDE4AP27815 886 aa27.04■■□□□ 1.92
KCNQ1-202ENST00000335475 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.04■■□□□ 1.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.04■■□□□ 1.92
KCNQ1-202ENST00000335475 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
KCNQ1-202ENST00000335475 BACH2Q9BYV9 841 aa27.04■■□□□ 1.92
KCNQ1-202ENST00000335475 FYB1O15117 783 aa27.03■■□□□ 1.92
KCNQ1-202ENST00000335475 SKAP1Q86WV1 359 aa27.03■■□□□ 1.92
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR63Q8IWG1 891 aa27.03■■□□□ 1.92
KCNQ1-202ENST00000335475 CDK19Q9BWU1 502 aa27.03■■□□□ 1.92
KCNQ1-202ENST00000335475 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.02■■□□□ 1.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
KCNQ1-202ENST00000335475 MLECQ14165 292 aa27.01■■□□□ 1.91
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP7BP35670 1465 aa27.01■■□□□ 1.91
KCNQ1-202ENST00000335475 NEUROD2Q15784 382 aa27.01■■□□□ 1.91
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KCNQ1-202ENST00000335475 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
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KCNQ1-202ENST00000335475 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
KCNQ1-202ENST00000335475 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.97■■□□□ 1.91
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KCNQ1-202ENST00000335475 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
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KCNQ1-202ENST00000335475 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.95■■□□□ 1.91
KCNQ1-202ENST00000335475 CABP1Q9NZU7 370 aa26.95■■□□□ 1.91
KCNQ1-202ENST00000335475 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
KCNQ1-202ENST00000335475 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.95■■□□□ 1.9
KCNQ1-202ENST00000335475 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
KCNQ1-202ENST00000335475 METP08581 1390 aa26.93■■□□□ 1.9
KCNQ1-202ENST00000335475 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.93■■□□□ 1.9
KCNQ1-202ENST00000335475 CPS1P31327 1500 aa26.92■■□□□ 1.9
KCNQ1-202ENST00000335475 TECPR2O15040 1411 aa26.92■■□□□ 1.9
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
KCNQ1-202ENST00000335475 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
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