RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.77■■■□□ 2.2
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RAB11B-201ENST00000328024 POGKQ9P215 609 aa28.74■■■□□ 2.19
RAB11B-201ENST00000328024 PIP4K2BP78356 416 aa28.72■■■□□ 2.19
RAB11B-201ENST00000328024 ATF3P18847 181 aa28.71■■■□□ 2.19
RAB11B-201ENST00000328024 DCCP43146 1447 aa28.71■■■□□ 2.19
RAB11B-201ENST00000328024 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.7■■■□□ 2.19
RAB11B-201ENST00000328024 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.7■■■□□ 2.19
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RAB11B-201ENST00000328024 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
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RAB11B-201ENST00000328024 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
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RAB11B-201ENST00000328024 ADGRB2O60241 1585 aa28.6■■■□□ 2.17
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RAB11B-201ENST00000328024 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.59■■■□□ 2.17
RAB11B-201ENST00000328024 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.58■■■□□ 2.17
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RAB11B-201ENST00000328024 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.56■■■□□ 2.16
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RAB11B-201ENST00000328024 USP32Q8NFA0 1604 aa28.51■■■□□ 2.15
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RAB11B-201ENST00000328024 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
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RAB11B-201ENST00000328024 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.48■■■□□ 2.15
RAB11B-201ENST00000328024 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.48■■■□□ 2.15
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RAB11B-201ENST00000328024 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.45■■■□□ 2.14
RAB11B-201ENST00000328024 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.44■■■□□ 2.14
RAB11B-201ENST00000328024 CABP2Q9NPB3 220 aa28.44■■■□□ 2.14
RAB11B-201ENST00000328024 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
RAB11B-201ENST00000328024 ATP7BP35670 1465 aa28.42■■■□□ 2.14
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RAB11B-201ENST00000328024 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
RAB11B-201ENST00000328024 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
RAB11B-201ENST00000328024 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.39■■■□□ 2.14
RAB11B-201ENST00000328024 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.39■■■□□ 2.13
RAB11B-201ENST00000328024 FOXO3O43524 673 aa28.38■■■□□ 2.13
RAB11B-201ENST00000328024 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.38■■■□□ 2.13
RAB11B-201ENST00000328024 PHLPP1O60346 1717 aa28.37■■■□□ 2.13
RAB11B-201ENST00000328024 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
RAB11B-201ENST00000328024 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
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RAB11B-201ENST00000328024 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
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RAB11B-201ENST00000328024 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
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RAB11B-201ENST00000328024 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
RAB11B-201ENST00000328024 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.31■■■□□ 2.12
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RAB11B-201ENST00000328024 ITSN1Q15811 1721 aa28.29■■■□□ 2.12
RAB11B-201ENST00000328024 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.29■■■□□ 2.12
RAB11B-201ENST00000328024 CABP1Q9NZU7 370 aa28.28■■■□□ 2.12
RAB11B-201ENST00000328024 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.28■■■□□ 2.12
RAB11B-201ENST00000328024 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.26■■■□□ 2.11
RAB11B-201ENST00000328024 ACEP12821 1306 aa28.25■■■□□ 2.11
RAB11B-201ENST00000328024 TMF1P82094 1093 aa28.24■■■□□ 2.11
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RAB11B-201ENST00000328024 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.23■■■□□ 2.11
RAB11B-201ENST00000328024 SLC24A1O60721 1099 aa28.23■■■□□ 2.11
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RAB11B-201ENST00000328024 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.19■■■□□ 2.1
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RAB11B-201ENST00000328024 SBNO1A3KN83 1393 aa28.15■■■□□ 2.1
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RAB11B-201ENST00000328024 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
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RAB11B-201ENST00000328024 USP6P35125 1406 aa28.1■■■□□ 2.09
RAB11B-201ENST00000328024 AKAP12Q02952 1782 aa28.09■■■□□ 2.09
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RAB11B-201ENST00000328024 ALS2Q96Q42 1657 aa28.08■■■□□ 2.09
RAB11B-201ENST00000328024 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.07■■■□□ 2.08
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
RAB11B-201ENST00000328024 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
RAB11B-201ENST00000328024 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.06■■■□□ 2.08
RAB11B-201ENST00000328024 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.06■■■□□ 2.08
RAB11B-201ENST00000328024 LRP6O75581 1613 aa28.06■■■□□ 2.08
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