RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 MS4A1P11836 297 aa21.38■■□□□ 1.01
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SHQ1-201ENST00000325599 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SHQ1-201ENST00000325599 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.37■■□□□ 1.01
SHQ1-201ENST00000325599 IDI1Q13907 227 aa21.37■■□□□ 1.01
SHQ1-201ENST00000325599 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
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SHQ1-201ENST00000325599 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.05■□□□□ 0.96
SHQ1-201ENST00000325599 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.05■□□□□ 0.96
SHQ1-201ENST00000325599 MLECQ14165 292 aa21.05■□□□□ 0.96
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.05■□□□□ 0.96
SHQ1-201ENST00000325599 FBLN1P23142 703 aa21.04■□□□□ 0.96
SHQ1-201ENST00000325599 ADGRB2O60241 1585 aa21.04■□□□□ 0.96
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