RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 EVC2Q86UK5 1308 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF521Q96K83 1311 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-202ENST00000323081 GOLGA2Q08379 1002 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-202ENST00000323081 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-202ENST00000323081 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-202ENST00000323081 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-202ENST00000323081 PTPRMP28827 1452 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-202ENST00000323081 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-202ENST00000323081 STK26Q9P289 416 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 ALKQ9UM73 1620 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 APAF1O14727 1248 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 MORC1Q86VD1 984 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 CABP2Q9NPB3 220 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 MLECQ14165 292 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 SHPRHQ149N8 1683 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 SLFN5Q08AF3 891 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 CRBNQ96SW2 442 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-202ENST00000323081 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-202ENST00000323081 PRAM1Q96QH2 718 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-202ENST00000323081 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-202ENST00000323081 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-202ENST00000323081 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-202ENST00000323081 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-202ENST00000323081 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-202ENST00000323081 A0A1W2PP64 1363 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-202ENST00000323081 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-202ENST00000323081 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-202ENST00000323081 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-202ENST00000323081 NGEFQ8N5V2 710 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-202ENST00000323081 NSD2O96028 1365 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 POGKQ9P215 609 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 E9PSI1 815 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 ZMYM3Q14202 1370 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 ABCC11Q96J66 1382 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 MTHFSP49914 203 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 DLC1Q96QB1 1528 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 CFAP53Q96M91 514 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-202ENST00000323081 WWC1Q8IX03 1113 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 RUNDC1Q96C34 613 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 CDK19Q9BWU1 502 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 BCL11AQ9H165 835 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 NLRP1Q9C000 1473 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 NEUROD2Q15784 382 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 BCAR3O75815 825 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-202ENST00000323081 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 MED14O60244 1454 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 FYB1O15117 783 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 MS4A1P11836 297 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 METP08581 1390 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 CABP1Q9NZU7 370 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 TNRQ92752 1358 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 PDE4AP27815 886 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 SKAP1Q86WV1 359 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-202ENST00000323081 BACH2Q9BYV9 841 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-202ENST00000323081 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-202ENST00000323081 WDR63Q8IWG1 891 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-202ENST00000323081 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-202ENST00000323081 ADGRB2O60241 1585 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-202ENST00000323081 ATP7BP35670 1465 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC27Q2M243 656 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-202ENST00000323081 TECPR2O15040 1411 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-202ENST00000323081 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-202ENST00000323081 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SPNS1-202ENST00000323081 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SPNS1-202ENST00000323081 CPS1P31327 1500 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS1-202ENST00000323081 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
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