RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 FSD2A1L4K1 749 aa28.34■■■□□ 2.13
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTPRTO14522 1441 aa28.34■■■□□ 2.13
GRAMD1A-201ENST00000317991 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
GRAMD1A-201ENST00000317991 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.33■■■□□ 2.13
GRAMD1A-201ENST00000317991 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.31■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.3■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 AAMPQ13685 434 aa28.3■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRAK2O60296 914 aa28.29■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 WDR63Q8IWG1 891 aa28.29■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.29■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 SHPRHQ149N8 1683 aa28.28■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLCH2O75038 1416 aa28.28■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTHFSP49914 203 aa28.27■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.27■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.26■■■□□ 2.12
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZMYM3Q14202 1370 aa28.26■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.25■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.25■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.25■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC24A1O60721 1099 aa28.22■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.22■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.22■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCA6Q8N139 1617 aa28.22■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCC1P33527 1531 aa28.2■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.2■■■□□ 2.11
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF3BO15066 747 aa28.2■■■□□ 2.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.19■■■□□ 2.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.18■■■□□ 2.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLCN1P35523 988 aa28.18■■■□□ 2.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.17■■■□□ 2.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC27Q2M243 656 aa28.17■■■□□ 2.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM27P14373 513 aa28.15■■■□□ 2.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.15■■■□□ 2.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 MRE11P49959 708 aa28.15■■■□□ 2.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.15■■■□□ 2.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSCBQ8IWL3 235 aa28.14■■■□□ 2.1
GRAMD1A-201ENST00000317991 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 TET3O43151 1660 aa28.13■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 KANK1Q14678 1352 aa28.13■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRPEL1Q9HAV7 217 aa28.13■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 CFAP53Q96M91 514 aa28.12■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.12■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.11■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.11■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.11■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.1■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYOM2P54296 1465 aa28.1■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.08■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERBB4Q15303 1308 aa28.08■■■□□ 2.09
GRAMD1A-201ENST00000317991 DEPDC5O75140 1603 aa28.07■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX11L8A8MPP1 907 aa28.07■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDIT3P35638 169 aa28.06■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMC5Q8IY18 1101 aa28.06■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 GAS2L3Q86XJ1 694 aa28.05■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.05■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.05■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOS1P29475 1434 aa28.05■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.05■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASXL2Q76L83 1435 aa28.04■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.04■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 LNPKQ9C0E8 428 aa28.04■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 FOXD4L1Q9NU39 408 aa28.03■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 ESPNB1AK53 854 aa28.02■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.02■■■□□ 2.08
GRAMD1A-201ENST00000317991 MROH2AA6NES4 1674 aa28.01■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 VWDEQ8N2E2 1590 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF1BO60333 1816 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 CD109Q6YHK3 1445 aa27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.97■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNX21Q969T3 373 aa27.96■■■□□ 2.07
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUCB1Q02818 461 aa27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms