RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306732.7

PITX2-201, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX2, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-201ENST00000306732 ADGRL1O94910 1474 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX2-201ENST00000306732 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 TNNQ9UQP3 1299 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 RLBP1P12271 317 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 IFT172Q9UG01 1749 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 MROH2AA6NES4 1674 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 MORC1Q86VD1 984 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 BECN1Q14457 450 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 RUNDC1Q96C34 613 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 KIF1BO60333 1816 aa25.22■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.22■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.21■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 POGKQ9P215 609 aa25.21■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 ASXL2Q76L83 1435 aa25.21■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.21■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
PITX2-201ENST00000306732 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.2■■□□□ 1.62
PITX2-201ENST00000306732 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX2-201ENST00000306732 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.18■■□□□ 1.62
PITX2-201ENST00000306732 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX2-201ENST00000306732 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.17■■□□□ 1.62
PITX2-201ENST00000306732 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX2-201ENST00000306732 NOS1P29475 1434 aa25.16■■□□□ 1.62
PITX2-201ENST00000306732 WDR63Q8IWG1 891 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX2-201ENST00000306732 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX2-201ENST00000306732 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX2-201ENST00000306732 AAMPQ13685 434 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX2-201ENST00000306732 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX2-201ENST00000306732 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.13■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 MTHFSP49914 203 aa25.13■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 ZMYM3Q14202 1370 aa25.12■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.12■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.12■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.11■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 CCDC27Q2M243 656 aa25.09■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 ADGRB3O60242 1522 aa25.09■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.08■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.08■■□□□ 1.61
PITX2-201ENST00000306732 USP32Q8NFA0 1604 aa25.07■■□□□ 1.6
PITX2-201ENST00000306732 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PITX2-201ENST00000306732 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.06■■□□□ 1.6
PITX2-201ENST00000306732 ADGRB1O14514 1584 aa25.06■■□□□ 1.6
PITX2-201ENST00000306732 CFAP53Q96M91 514 aa25.05■■□□□ 1.6
PITX2-201ENST00000306732 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.05■■□□□ 1.6
PITX2-201ENST00000306732 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PITX2-201ENST00000306732 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX2-201ENST00000306732 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
PITX2-201ENST00000306732 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.02■■□□□ 1.6
PITX2-201ENST00000306732 PPLO60437 1756 aa25.01■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.01■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 ADGRB2O60241 1585 aa25■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.99■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.98■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 CD109Q6YHK3 1445 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 NPATQ14207 1427 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX2-201ENST00000306732 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.95■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.95■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.95■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.95■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 TRIM27P14373 513 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 ARXQ96QS3 562 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 NSD2O96028 1365 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 MCM4P33991 863 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 GLI2P10070 1586 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 EVC2Q86UK5 1308 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 CABP2Q9NPB3 220 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.89■■□□□ 1.58
PITX2-201ENST00000306732 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms