RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 SKAP1Q86WV1 359 aa26.31■■□□□ 1.8
HPS6-201ENST00000299238 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.3■■□□□ 1.8
HPS6-201ENST00000299238 NFKBIBQ15653 356 aa26.28■■□□□ 1.8
HPS6-201ENST00000299238 CRBNQ96SW2 442 aa26.28■■□□□ 1.8
HPS6-201ENST00000299238 PDE4AP27815 886 aa26.27■■□□□ 1.8
HPS6-201ENST00000299238 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.27■■□□□ 1.8
HPS6-201ENST00000299238 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.27■■□□□ 1.8
HPS6-201ENST00000299238 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
HPS6-201ENST00000299238 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.27■■□□□ 1.8
HPS6-201ENST00000299238 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.27■■□□□ 1.8
HPS6-201ENST00000299238 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.26■■□□□ 1.79
HPS6-201ENST00000299238 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.25■■□□□ 1.79
HPS6-201ENST00000299238 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.25■■□□□ 1.79
HPS6-201ENST00000299238 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.25■■□□□ 1.79
HPS6-201ENST00000299238 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.25■■□□□ 1.79
HPS6-201ENST00000299238 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.24■■□□□ 1.79
HPS6-201ENST00000299238 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HPS6-201ENST00000299238 DIP2BQ9P265 1576 aa26.23■■□□□ 1.79
HPS6-201ENST00000299238 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
HPS6-201ENST00000299238 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.23■■□□□ 1.79
HPS6-201ENST00000299238 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.21■■□□□ 1.79
HPS6-201ENST00000299238 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
HPS6-201ENST00000299238 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa26.21■■□□□ 1.79
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA2Q08379 1002 aa26.2■■□□□ 1.79
HPS6-201ENST00000299238 SLC4A3P48751 1232 aa26.2■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 IDI1Q13907 227 aa26.2■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 BACH2Q9BYV9 841 aa26.19■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.19■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.18■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 TSPOAP1O95153 1857 aa26.18■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 USP32Q8NFA0 1604 aa26.18■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.17■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 SLFN5Q08AF3 891 aa26.17■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.17■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 ZFYVE9O95405 1425 aa26.16■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 MS4A1P11836 297 aa26.16■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.15■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.15■■□□□ 1.78
HPS6-201ENST00000299238 APAF1O14727 1248 aa26.12■■□□□ 1.77
HPS6-201ENST00000299238 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
HPS6-201ENST00000299238 SHPRHQ149N8 1683 aa26.11■■□□□ 1.77
HPS6-201ENST00000299238 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
HPS6-201ENST00000299238 EVC2Q86UK5 1308 aa26.1■■□□□ 1.77
HPS6-201ENST00000299238 REREQ9P2R6 1566 aa26.09■■□□□ 1.77
HPS6-201ENST00000299238 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.08■■□□□ 1.77
HPS6-201ENST00000299238 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
HPS6-201ENST00000299238 MORC1Q86VD1 984 aa26.08■■□□□ 1.77
HPS6-201ENST00000299238 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
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HPS6-201ENST00000299238 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.04■■□□□ 1.76
HPS6-201ENST00000299238 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
HPS6-201ENST00000299238 AGLP35573 1532 aa26.04■■□□□ 1.76
HPS6-201ENST00000299238 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
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HPS6-201ENST00000299238 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
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HPS6-201ENST00000299238 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.03■■□□□ 1.76
HPS6-201ENST00000299238 NGEFQ8N5V2 710 aa26.03■■□□□ 1.76
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
HPS6-201ENST00000299238 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.03■■□□□ 1.76
HPS6-201ENST00000299238 PTPRMP28827 1452 aa26.02■■□□□ 1.76
HPS6-201ENST00000299238 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
HPS6-201ENST00000299238 E9PSI1 815 aa26.01■■□□□ 1.76
HPS6-201ENST00000299238 STK26Q9P289 416 aa26.01■■□□□ 1.75
HPS6-201ENST00000299238 CABP2Q9NPB3 220 aa26.01■■□□□ 1.75
HPS6-201ENST00000299238 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.99■■□□□ 1.75
HPS6-201ENST00000299238 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
HPS6-201ENST00000299238 BCAR3O75815 825 aa25.98■■□□□ 1.75
HPS6-201ENST00000299238 NSD2O96028 1365 aa25.98■■□□□ 1.75
HPS6-201ENST00000299238 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
HPS6-201ENST00000299238 ALKQ9UM73 1620 aa25.97■■□□□ 1.75
HPS6-201ENST00000299238 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.95■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 WWC1Q8IX03 1113 aa25.94■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.94■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.93■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 A0A1W2PP64 1363 aa25.93■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 NEUROD2Q15784 382 aa25.93■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.92■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 MTHFSP49914 203 aa25.92■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 PRAM1Q96QH2 718 aa25.92■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.91■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.91■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 ABCC11Q96J66 1382 aa25.91■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.89■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.89■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.89■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.89■■□□□ 1.74
HPS6-201ENST00000299238 RGS3P49796 1198 aa25.89■■□□□ 1.73
HPS6-201ENST00000299238 CFAP53Q96M91 514 aa25.89■■□□□ 1.73
HPS6-201ENST00000299238 RUNDC1Q96C34 613 aa25.88■■□□□ 1.73
HPS6-201ENST00000299238 POGKQ9P215 609 aa25.88■■□□□ 1.73
HPS6-201ENST00000299238 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
HPS6-201ENST00000299238 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
HPS6-201ENST00000299238 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
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