RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.21■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.2■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.19■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 CDK19Q9BWU1 502 aa22.19■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.18■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.18■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.17■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 CABP1Q9NZU7 370 aa22.16■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 ZMYM3Q14202 1370 aa22.16■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 CFAP53Q96M91 514 aa22.16■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.14■■□□□ 1.14
PKN3-201ENST00000291906 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.14■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 NUTM2FA1L443 756 aa22.13■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.13■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.13■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.12■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 CRBNQ96SW2 442 aa22.12■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.12■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.12■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 FBLN1P23142 703 aa22.12■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.12■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 A0A1W2PP64 1363 aa22.11■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.1■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.1■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 ZFYVE9O95405 1425 aa22.09■■□□□ 1.13
PKN3-201ENST00000291906 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.08■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 SLFN5Q08AF3 891 aa22.07■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.07■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.07■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 ALKQ9UM73 1620 aa22.05■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 FYB1O15117 783 aa22.05■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.05■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 AGLP35573 1532 aa22.05■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.04■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.04■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 RUNDC1Q96C34 613 aa22.04■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 TNRQ92752 1358 aa22.03■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 PTPRMP28827 1452 aa22.03■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 BCAR3O75815 825 aa22.03■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 INSRP06213 1382 aa22.03■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 SKAP1Q86WV1 359 aa22.02■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 WWC1Q8IX03 1113 aa22.02■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 METP08581 1390 aa22.02■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 ZNF521Q96K83 1311 aa22.02■■□□□ 1.12
PKN3-201ENST00000291906 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PKN3-201ENST00000291906 E9PSI1 815 aa22■■□□□ 1.11
PKN3-201ENST00000291906 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22■■□□□ 1.11
PKN3-201ENST00000291906 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PKN3-201ENST00000291906 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PKN3-201ENST00000291906 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.98■■□□□ 1.11
PKN3-201ENST00000291906 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.97■■□□□ 1.11
PKN3-201ENST00000291906 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PKN3-201ENST00000291906 SOX12O15370 315 aa21.96■■□□□ 1.11
PKN3-201ENST00000291906 LTKP29376 864 aa21.96■■□□□ 1.11
PKN3-201ENST00000291906 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.95■■□□□ 1.1
PKN3-201ENST00000291906 ABCC11Q96J66 1382 aa21.95■■□□□ 1.1
PKN3-201ENST00000291906 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PKN3-201ENST00000291906 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.94■■□□□ 1.1
PKN3-201ENST00000291906 NME9Q86XW9 330 aa21.94■■□□□ 1.1
PKN3-201ENST00000291906 REREQ9P2R6 1566 aa21.94■■□□□ 1.1
PKN3-201ENST00000291906 EID1Q9Y6B2 187 aa21.92■■□□□ 1.1
PKN3-201ENST00000291906 NSD2O96028 1365 aa21.92■■□□□ 1.1
PKN3-201ENST00000291906 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PKN3-201ENST00000291906 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.9■■□□□ 1.1
PKN3-201ENST00000291906 HMOX1P09601 288 aa21.9■■□□□ 1.1
PKN3-201ENST00000291906 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PKN3-201ENST00000291906 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.89■■□□□ 1.1
PKN3-201ENST00000291906 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.88■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.88■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 PANK1Q8TE04 598 aa21.88■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.88■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.88■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.87■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 COG6Q9Y2V7 657 aa21.86■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.86■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 NGEFQ8N5V2 710 aa21.85■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 NEFMP07197 916 aa21.85■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 RIPK4P57078 832 aa21.84■■□□□ 1.09
PKN3-201ENST00000291906 POLKQ9UBT6 870 aa21.84■■□□□ 1.09
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