RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 DIP2BQ9P265 1576 aa25.28■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 TSPOAP1O95153 1857 aa25.27■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.26■■□□□ 1.63
USP21-201ENST00000289865 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
USP21-201ENST00000289865 SHPRHQ149N8 1683 aa25.26■■□□□ 1.63
USP21-201ENST00000289865 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.25■■□□□ 1.63
USP21-201ENST00000289865 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
USP21-201ENST00000289865 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
USP21-201ENST00000289865 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
USP21-201ENST00000289865 STK26Q9P289 416 aa25.24■■□□□ 1.63
USP21-201ENST00000289865 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
USP21-201ENST00000289865 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.23■■□□□ 1.63
USP21-201ENST00000289865 CABP2Q9NPB3 220 aa25.23■■□□□ 1.63
USP21-201ENST00000289865 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.23■■□□□ 1.63
USP21-201ENST00000289865 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
USP21-201ENST00000289865 NGEFQ8N5V2 710 aa25.2■■□□□ 1.62
USP21-201ENST00000289865 E9PSI1 815 aa25.19■■□□□ 1.62
USP21-201ENST00000289865 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
USP21-201ENST00000289865 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
USP21-201ENST00000289865 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.18■■□□□ 1.62
USP21-201ENST00000289865 MTHFSP49914 203 aa25.17■■□□□ 1.62
USP21-201ENST00000289865 PTPRMP28827 1452 aa25.16■■□□□ 1.62
USP21-201ENST00000289865 NSD2O96028 1365 aa25.16■■□□□ 1.62
USP21-201ENST00000289865 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
USP21-201ENST00000289865 REREQ9P2R6 1566 aa25.15■■□□□ 1.62
USP21-201ENST00000289865 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 WWC1Q8IX03 1113 aa25.13■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 CFAP53Q96M91 514 aa25.13■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.13■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 RUNDC1Q96C34 613 aa25.12■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 PRAM1Q96QH2 718 aa25.12■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 AGLP35573 1532 aa25.12■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 A0A1W2PP64 1363 aa25.12■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.12■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 ALKQ9UM73 1620 aa25.12■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.11■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 POGKQ9P215 609 aa25.11■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 BCAR3O75815 825 aa25.09■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 MS4A1P11836 297 aa25.09■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 NEUROD2Q15784 382 aa25.09■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.08■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 ABCC11Q96J66 1382 aa25.08■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.08■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.08■■□□□ 1.61
USP21-201ENST00000289865 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.07■■□□□ 1.6
USP21-201ENST00000289865 PDE4AP27815 886 aa25.07■■□□□ 1.6
USP21-201ENST00000289865 SKAP1Q86WV1 359 aa25.07■■□□□ 1.6
USP21-201ENST00000289865 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
USP21-201ENST00000289865 MLECQ14165 292 aa25.04■■□□□ 1.6
USP21-201ENST00000289865 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.04■■□□□ 1.6
USP21-201ENST00000289865 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
USP21-201ENST00000289865 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.03■■□□□ 1.6
USP21-201ENST00000289865 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.03■■□□□ 1.6
USP21-201ENST00000289865 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
USP21-201ENST00000289865 BACH2Q9BYV9 841 aa25.03■■□□□ 1.6
USP21-201ENST00000289865 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.03■■□□□ 1.6
USP21-201ENST00000289865 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.02■■□□□ 1.6
USP21-201ENST00000289865 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.01■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 CDK19Q9BWU1 502 aa25■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.99■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.99■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 WDR63Q8IWG1 891 aa24.98■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 FYB1O15117 783 aa24.97■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 CCDC27Q2M243 656 aa24.97■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 ADGRB2O60241 1585 aa24.96■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 NLRP1Q9C000 1473 aa24.96■■□□□ 1.59
USP21-201ENST00000289865 MED14O60244 1454 aa24.95■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 DLC1Q96QB1 1528 aa24.95■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 CABP1Q9NZU7 370 aa24.94■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.93■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.93■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 PDE3AQ14432 1141 aa24.93■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.93■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 PANK1Q8TE04 598 aa24.89■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
USP21-201ENST00000289865 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
USP21-201ENST00000289865 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.88■■□□□ 1.57
USP21-201ENST00000289865 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.88■■□□□ 1.57
USP21-201ENST00000289865 COG6Q9Y2V7 657 aa24.87■■□□□ 1.57
USP21-201ENST00000289865 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.87■■□□□ 1.57
USP21-201ENST00000289865 ZMYM3Q14202 1370 aa24.86■■□□□ 1.57
USP21-201ENST00000289865 ATP7BP35670 1465 aa24.84■■□□□ 1.57
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