RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289382.7

CNOT11-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT11, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11-201ENST00000289382 PANK2Q9BZ23 570 aa23.98■■□□□ 1.43
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CNOT11-201ENST00000289382 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.97■■□□□ 1.43
CNOT11-201ENST00000289382 GGT6Q6P531 493 aa23.97■■□□□ 1.43
CNOT11-201ENST00000289382 MROH2AA6NES4 1674 aa23.96■■□□□ 1.43
CNOT11-201ENST00000289382 ASXL2Q76L83 1435 aa23.96■■□□□ 1.43
CNOT11-201ENST00000289382 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.96■■□□□ 1.43
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CNOT11-201ENST00000289382 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.96■■□□□ 1.43
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CNOT11-201ENST00000289382 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.95■■□□□ 1.42
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CNOT11-201ENST00000289382 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.87■■□□□ 1.41
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CNOT11-201ENST00000289382 TNNQ9UQP3 1299 aa23.84■■□□□ 1.41
CNOT11-201ENST00000289382 NPATQ14207 1427 aa23.84■■□□□ 1.41
CNOT11-201ENST00000289382 IFT172Q9UG01 1749 aa23.83■■□□□ 1.41
CNOT11-201ENST00000289382 TRAK2O60296 914 aa23.83■■□□□ 1.41
CNOT11-201ENST00000289382 MRE11P49959 708 aa23.83■■□□□ 1.41
CNOT11-201ENST00000289382 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.83■■□□□ 1.41
CNOT11-201ENST00000289382 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.4
CNOT11-201ENST00000289382 MORC1Q86VD1 984 aa23.83■■□□□ 1.4
CNOT11-201ENST00000289382 ZMYM3Q14202 1370 aa23.82■■□□□ 1.4
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CNOT11-201ENST00000289382 RAPGEF3O95398 923 aa23.81■■□□□ 1.4
CNOT11-201ENST00000289382 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.81■■□□□ 1.4
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CNOT11-201ENST00000289382 ESPNB1AK53 854 aa23.77■■□□□ 1.4
CNOT11-201ENST00000289382 MTHFSP49914 203 aa23.76■■□□□ 1.39
CNOT11-201ENST00000289382 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.76■■□□□ 1.39
CNOT11-201ENST00000289382 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.76■■□□□ 1.39
CNOT11-201ENST00000289382 ERBB4Q15303 1308 aa23.76■■□□□ 1.39
CNOT11-201ENST00000289382 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.75■■□□□ 1.39
CNOT11-201ENST00000289382 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CNOT11-201ENST00000289382 CD109Q6YHK3 1445 aa23.74■■□□□ 1.39
CNOT11-201ENST00000289382 CABP2Q9NPB3 220 aa23.74■■□□□ 1.39
CNOT11-201ENST00000289382 ADGRB1O14514 1584 aa23.73■■□□□ 1.39
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CNOT11-201ENST00000289382 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.72■■□□□ 1.39
CNOT11-201ENST00000289382 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.71■■□□□ 1.39
CNOT11-201ENST00000289382 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.71■■□□□ 1.39
CNOT11-201ENST00000289382 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.71■■□□□ 1.39
CNOT11-201ENST00000289382 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.71■■□□□ 1.39
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CNOT11-201ENST00000289382 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.71■■□□□ 1.39
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CNOT11-201ENST00000289382 SLC24A1O60721 1099 aa23.69■■□□□ 1.38
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CNOT11-201ENST00000289382 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.66■■□□□ 1.38
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CNOT11-201ENST00000289382 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CNOT11-201ENST00000289382 IDI1Q13907 227 aa23.64■■□□□ 1.38
CNOT11-201ENST00000289382 HSCBQ8IWL3 235 aa23.64■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 ABCC3O15438 1527 aa23.64■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.371e-8■■■■□ 21.5
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