RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.52■□□□□ 0.88
POP4-201ENST00000221770 EVC2Q86UK5 1308 aa20.52■□□□□ 0.87
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POP4-201ENST00000221770 E9PSI1 815 aa20.51■□□□□ 0.87
POP4-201ENST00000221770 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.5■□□□□ 0.87
POP4-201ENST00000221770 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
POP4-201ENST00000221770 RICTORQ6R327 1708 aa20.49■□□□□ 0.87
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POP4-201ENST00000221770 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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POP4-201ENST00000221770 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.87
POP4-201ENST00000221770 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.44■□□□□ 0.86
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POP4-201ENST00000221770 USP32Q8NFA0 1604 aa20.43■□□□□ 0.86
POP4-201ENST00000221770 WWC1Q8IX03 1113 aa20.43■□□□□ 0.86
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POP4-201ENST00000221770 MTHFSP49914 203 aa20.42■□□□□ 0.86
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POP4-201ENST00000221770 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.39■□□□□ 0.86
POP4-201ENST00000221770 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
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POP4-201ENST00000221770 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
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POP4-201ENST00000221770 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.38■□□□□ 0.85
POP4-201ENST00000221770 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.37■□□□□ 0.85
POP4-201ENST00000221770 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.37■□□□□ 0.85
POP4-201ENST00000221770 SHPRHQ149N8 1683 aa20.37■□□□□ 0.85
POP4-201ENST00000221770 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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POP4-201ENST00000221770 WDR63Q8IWG1 891 aa20.35■□□□□ 0.85
POP4-201ENST00000221770 NEUROD2Q15784 382 aa20.35■□□□□ 0.85
POP4-201ENST00000221770 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.35■□□□□ 0.85
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POP4-201ENST00000221770 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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POP4-201ENST00000221770 PTPRMP28827 1452 aa20.31■□□□□ 0.84
POP4-201ENST00000221770 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.31■□□□□ 0.84
POP4-201ENST00000221770 A0A1W2PP64 1363 aa20.3■□□□□ 0.84
POP4-201ENST00000221770 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
POP4-201ENST00000221770 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
POP4-201ENST00000221770 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
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POP4-201ENST00000221770 AGLP35573 1532 aa20.25■□□□□ 0.83
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POP4-201ENST00000221770 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.25■□□□□ 0.83
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POP4-201ENST00000221770 COG6Q9Y2V7 657 aa20.21■□□□□ 0.83
POP4-201ENST00000221770 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.21■□□□□ 0.83
POP4-201ENST00000221770 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
POP4-201ENST00000221770 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.21■□□□□ 0.83
POP4-201ENST00000221770 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.21■□□□□ 0.83
POP4-201ENST00000221770 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.21■□□□□ 0.83
POP4-201ENST00000221770 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.2■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 IGHDP01880 384 aa20.2■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.2■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 CABP1Q9NZU7 370 aa20.2■□□□□ 0.82
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