RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YLR236CA0A023PZG4 107 aa1.27□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C RPL36BO14455 100 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C EDC1P53080 175 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C MMS2P53152 137 aa1.27□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C ERI1P62651 68 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C VAM10Q08474 114 aa1.27□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C CCW12Q12127 133 aa1.27□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YMR175W-AQ3E766 64 aa1.27□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa1.27□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YHL005CP38752 130 aa1.26□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C ICS3P47034 131 aa1.26□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C HOR7Q05827 59 aa1.26□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YDR182W-AQ3E796 67 aa1.26□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C RRT15Q3E811 62 aa1.26□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C OST5Q92316 86 aa1.26□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C MIC10Q96VH5 97 aa1.26□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YAR023CD6VPM8 179 aa1.25□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YAL065CO13511 128 aa1.25□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YFR009W-AP0C5M9 85 aa1.25□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C MVB12P42939 101 aa1.25□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YLR162WQ06235 118 aa1.25□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YKL065W-AQ2V2P2 73 aa1.25□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YJL127C-BQ3E828 52 aa1.25□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C TDA8Q6B2U8 126 aa1.25□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YPR010C-AA5Z2X5 72 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YBL039W-BP0C268 59 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C AQY2P0CD90 149 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YHL037CP38733 133 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C COX23P38824 151 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YDR274CP87283 123 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C LIP1Q03579 150 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YMR122CQ03879 124 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YPR013CQ12145 317 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YDR246W-AQ3E763 66 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YCR095W-AQ3E787 52 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YJL133C-AQ3E7A3 74 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YOR376W-AQ3E805 51 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YGR121W-AQ3E816 71 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YMR122W-AQ3E842 84 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C HUB1Q6Q546 73 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YHR213W-BQ8TGK1 99 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C Q0032Q9ZZX7 96 aa1.24□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C RPL29P05747 59 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YCR001WP25347 104 aa1.23□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C FYV5P25585 152 aa1.23□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YAL064WP39711 94 aa1.23□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YDL241WQ07738 123 aa1.23□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C SDH6Q3E785 79 aa1.23□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YER188C-AP0C0V2 99 aa1.22□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YLR157W-DP0CE99 70 aa1.22□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C GAT4P40569 121 aa1.22□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C SNA2P56508 79 aa1.22□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YPR153WQ06537 140 aa1.22□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YOL014WQ08110 124 aa1.22□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YBR230W-AQ3E762 66 aa1.22□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YGR240C-AQ3E786 66 aa1.22□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C YGR035W-AQ45U48 73 aa1.22□□□□□ -2.21
CSE4YKL049C SPG1P50088 95 aa1.21□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C BSC4P53841 131 aa1.21□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YHR007C-AQ07074 71 aa1.21□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa1.21□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa1.21□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C TAR1Q8TGM6 124 aa1.21□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YMR001C-AQ8TGS9 76 aa1.21□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YML100W-AQ8TGT0 57 aa1.21□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C BPH1P25356 2167 aa1.2□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C DDR48P18899 430 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YAR064WP39563 99 aa1.2□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C RPC10P40422 70 aa1.2□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C DDR2P89113 61 aa1.2□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C SGF11Q03067 99 aa1.2□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YOR072WQ08486 104 aa1.2□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YDR010CQ12426 110 aa1.2□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YGL041C-BQ3E750 60 aa1.2□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YBR027CP38220 110 aa1.19□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C RTC6O14464 93 aa1.18□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C RPL33AP05744 107 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YHR212W-AP0CX91 67 aa1.18□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C ATP17Q06405 101 aa1.18□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YIL156W-BQ2V2P4 73 aa1.18□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YFR032C-BQ8TGU2 87 aa1.18□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C AUA1P32450 94 aa1.17□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YLR307C-AQ3E825 87 aa1.17□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa1.17□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C QCR10P37299 77 aa1.16□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YGL193CP53097 103 aa1.16□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YGL149WP53116 101 aa1.16□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa1.16□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C Q0297Q9ZZV8 51 aa1.16□□□□□ -2.22
CSE4YKL049C MRX7P53869 86 aa1.15□□□□□ -2.23
CSE4YKL049C LCL2Q08045 131 aa1.15□□□□□ -2.23
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