RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	MGR2	Q02889	113 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	ICY1	Q04329	127 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	IRC21	Q04772	201 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YLR255C	O13574	117 aa		0.35	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	INO4	P13902	151 aa		0.35	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	DSE2	P38844	325 aa		0.35	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	SPC25	P40014	221 aa		0.35	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		0.35	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	COX19	Q3E731	98 aa		0.35	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YBL044W	P38194	122 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YHR130C	P38834	111 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	RSM18	P40033	138 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	JAC1	P53193	184 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YGR164W	P53291	111 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	ARL3	Q02804	198 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YMR103C	Q04436	120 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YLR162W	Q06235	118 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	ZEO1	Q08245	113 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YOP1	Q12402	180 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YOR072W-B	Q3E832	53 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	GLC8	P41818	229 aa		0.33	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	ICS3	P47034	131 aa		0.33	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	OLI1	P61829	76 aa		0.33	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	CYT2	Q00873	224 aa		0.33	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		0.33	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YML108W	Q03759	105 aa		0.33	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		0.33	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		0.33	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	COX8	P04039	78 aa		0.32	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YIL102C	P40488	101 aa		0.32	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	GTT1	P40582	234 aa		0.32	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	LIP1	Q03579	150 aa		0.32	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	ECM19	Q06011	112 aa		0.32	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	EMC6	Q12431	108 aa		0.32	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		0.32	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	MIC10	Q96VH5	97 aa		0.32	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	IGO2	Q9P305	131 aa		0.32	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	POP7	P38291	140 aa		0.31	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	ISD11	Q6Q560	94 aa		0.31	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YAR064W	P39563	99 aa		0.3	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	HUR1	P45820	110 aa		0.3	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	MRPS12	P53732	153 aa		0.3	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.3	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	COA6	Q3E846	104 aa		0.3	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		0.29	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	COX23	P38824	151 aa		0.29	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	SNN1	P48232	102 aa		0.29	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YHR050W-A	Q05451	56 aa		0.29	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		0.29	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	RAD6	P06104	172 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	SRB6	P32570	121 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	YKL044W	P36092	106 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	ATP18	P81450	59 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PAM16	YJL104W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.27	□□□□□ -2.37	not detected
PAM16	YJL104W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YCR050C	P25630	102 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YER181C	P40097	107 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	VMA21	P41806	77 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YGR039W	P53225	103 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	MRX7	P53869	86 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YLR296W	Q05898	108 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	CNL1	Q06333	122 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YOR394C-A	Q8TGJ0	55 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YGR146C-A	Q8TGT9	53 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	MRPL44	P19956	98 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YHR125W	P38831	101 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	CGR1	P53188	120 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	ELC1	Q03071	99 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YOL014W	Q08110	124 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	PAI3	P01094	68 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	SSS1	P35179	80 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	NSE4	P43124	402 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	ATP20	Q12233	115 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YNR077C	P53758	84 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YMR122C	Q03879	124 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37

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