RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W ERG28P40030 148 aa3.77□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W MVB12P42939 101 aa3.77□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W RPL38P49167 78 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W YDR246W-AQ3E763 66 aa3.77□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W RSM19P53733 91 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W TSC3Q3E790 80 aa3.76□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W ATP20Q12233 115 aa3.76□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W AIM4P38305 123 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W RSM18P40033 138 aa3.75□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W TDA2P40045 126 aa3.75□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W RPC10P40422 70 aa3.75□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W YDR274CP87283 123 aa3.75□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W YMR320WQ04897 101 aa3.75□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W AQY2P0CD90 149 aa3.74□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W YFL019CP43576 117 aa3.74□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W SBH1P52870 82 aa3.74□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W YKL183C-AQ3E765 70 aa3.74□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W YBL008W-AQ3E821 79 aa3.74□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W YBL039W-BP0C268 59 aa3.73□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W YAL064WP39711 94 aa3.73□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W YBR121C-AP0C5L4 52 aa3.72□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W UBC4P15731 148 aa3.72□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W BET1P22804 142 aa3.72□□□□□ -1.81
VHS1YDR247W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data3.72□□□□□ -1.81not detected
VHS1YDR247W FYV5P25585 152 aa3.71□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W ICS3P47034 131 aa3.71□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W YBR230W-AQ3E762 66 aa3.71□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa3.7□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W RPL33AP05744 107 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W RPL33BP41056 107 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W YOR314WQ12506 109 aa3.7□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W SGF11Q03067 99 aa3.69□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W YOL014WQ08110 124 aa3.69□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W YJL127C-BQ3E828 52 aa3.69□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W COX23P38824 151 aa3.68□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W SFT1P43682 97 aa3.68□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W YGL034CP53186 121 aa3.68□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W PRP8P33334 2413 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W RPL43BP0CX26 92 aa3.66□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W YLR307C-AQ3E825 87 aa3.66□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W KTI11Q3E840 82 aa3.66□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa3.66□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W YDR182W-AQ3E796 67 aa3.65□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa3.65□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W YGR035W-AQ45U48 73 aa3.65□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W TDA8Q6B2U8 126 aa3.65□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa3.65□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W KSH1Q8TGJ3 72 aa3.65□□□□□ -1.82
VHS1YDR247W RPL36BO14455 100 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W SPC1P46965 94 aa3.64□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W YJL133C-AQ3E7A3 74 aa3.64□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W RRT15Q3E811 62 aa3.64□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa3.64□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W Q0032Q9ZZX7 96 aa3.64□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W YHL005CP38752 130 aa3.62□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W YGR164WP53291 111 aa3.62□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W YAR023CD6VPM8 179 aa3.61□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W RTC6O14464 93 aa3.61□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W YIL102CP40488 101 aa3.61□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W SNA2P56508 79 aa3.61□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W YLR162WQ06235 118 aa3.61□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W YDL012CQ12489 107 aa3.61□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W YLR412C-AQ3E742 68 aa3.61□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W MEC1P38111 2368 aa3.6□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W LIP1Q03579 150 aa3.6□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W BSC4P53841 131 aa3.59□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W YHR007C-AQ07074 71 aa3.59□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W YGR121W-AQ3E816 71 aa3.59□□□□□ -1.83
VHS1YDR247W YPR195CQ06594 109 aa3.58□□□□□ -1.84
VHS1YDR247W YOR268CQ08734 132 aa3.58□□□□□ -1.84
VHS1YDR247W DDR2P89113 61 aa3.57□□□□□ -1.84
VHS1YDR247W YOR072WQ08486 104 aa3.57□□□□□ -1.84
VHS1YDR247W YGL041C-BQ3E750 60 aa3.57□□□□□ -1.84
VHS1YDR247W YOR381W-AQ3E804 55 aa3.57□□□□□ -1.84
VHS1YDR247W MIC10Q96VH5 97 aa3.57□□□□□ -1.84
VHS1YDR247W YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
VHS1YDR247W YGL193CP53097 103 aa3.55□□□□□ -1.84
VHS1YDR247W UTP20P35194 2493 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.85
VHS1YDR247W YMR122CQ03879 124 aa3.51□□□□□ -1.85
VHS1YDR247W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa3.51□□□□□ -1.85
VHS1YDR247W YCL042WP25572 119 aa3.51□□□□□ -1.85
VHS1YDR247W YAR064WP39563 99 aa3.51□□□□□ -1.85
VHS1YDR247W YJL197C-AP0C5P0 93 aa3.5□□□□□ -1.85
VHS1YDR247W YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa3.5□□□□□ -1.85
VHS1YDR247W YER188C-AP0C0V2 99 aa3.48□□□□□ -1.85
VHS1YDR247W AUA1P32450 94 aa3.48□□□□□ -1.85
VHS1YDR247W YHR125WP38831 101 aa3.48□□□□□ -1.85
VHS1YDR247W OST5Q92316 86 aa3.48□□□□□ -1.85
VHS1YDR247W YDR010CQ12426 110 aa3.47□□□□□ -1.85
VHS1YDR247W SDH6Q3E785 79 aa3.47□□□□□ -1.85
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