RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C ATP16Q12165 160 aa4.24□□□□□ -1.73
SPE3YPR069C YKL023C-AQ2V2P3 75 aa4.24□□□□□ -1.73
SPE3YPR069C CMC4Q3E7A9 73 aa4.24□□□□□ -1.73
SPE3YPR069C QCR8P08525 94 aa4.23□□□□□ -1.73
SPE3YPR069C YER039C-AP0CD97 72 aa4.23□□□□□ -1.73
SPE3YPR069C POP3P53833 195 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
SPE3YPR069C RPL29P05747 59 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
SPE3YPR069C SCM4P32564 187 aa4.22□□□□□ -1.73
SPE3YPR069C NSE4P43124 402 aa4.22□□□□□ -1.73
SPE3YPR069C ZEO1Q08245 113 aa4.22□□□□□ -1.73
SPE3YPR069C RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C YDL022C-AP0C5L6 82 aa4.2□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C YJR085CP47131 105 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C SPG1P50088 95 aa4.2□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C YLL006W-AQ3E814 58 aa4.2□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C YER134CP40081 178 aa4.19□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C YGR121W-AQ3E816 71 aa4.19□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C KTI11Q3E840 82 aa4.19□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C HAP3P13434 144 aa4.18□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C FYV4P38783 130 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C GTT1P40582 234 aa4.18□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C MRPS12P53732 153 aa4.18□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C YNL190WP53872 204 aa4.18□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C YML079WQ03629 201 aa4.18□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C UBC11P52492 156 aa4.17□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C YNL162W-AQ3E7A8 72 aa4.17□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C YKR041WP36134 250 aa4.16□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C YPL261CQ08976 102 aa4.16□□□□□ -1.74
SPE3YPR069C KSH1Q8TGJ3 72 aa4.15□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C KRE1P17260 313 aa4.14□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C DDR2P89113 61 aa4.14□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C YPL257WQ08974 193 aa4.14□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C SPT4P32914 102 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C HPA2Q06592 156 aa4.13□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa4.13□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C RPL28P02406 149 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C YOR020W-AQ3E824 90 aa4.11□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C RPL26AP05743 127 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C RPL26BP53221 127 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C UGX2P32772 223 aa4.09□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C YEL067CP39978 195 aa4.09□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C ARL3Q02804 198 aa4.09□□□□□ -1.75
SPE3YPR069C HOT13P36078 116 aa4.08□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C YBR230W-AQ3E762 66 aa4.08□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C IGO2Q9P305 131 aa4.08□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C ATP5P09457 212 aa4.07□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C YKL044WP36092 106 aa4.07□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C YPL073CP40323 161 aa4.07□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C CNL1Q06333 122 aa4.07□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C YNR077CP53758 84 aa4.06□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C ICY1Q04329 127 aa4.06□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C YJL127C-BQ3E828 52 aa4.06□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C COX10P21592 462 aa4.05□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C YCR007CP25354 239 aa4.05□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C DUT1P33317 147 aa4.05□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C PAU17Q12370 124 aa4.05□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C RGM1Q00453 211 aa4.04□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C IRC21Q04772 201 aa4.04□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C FYV5P25585 152 aa4.03□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C BSC4P53841 131 aa4.03□□□□□ -1.76
SPE3YPR069C SEC11P15367 167 aa4.02□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C MRPL44P19956 98 aa4.02□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C YIA6P40556 373 aa4.02□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C RPL37BP51402 88 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C SCS22Q6Q595 175 aa4.02□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C YLR236CA0A023PZG4 107 aa4.01□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C YBR027CP38220 110 aa4□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C YHR007C-AQ07074 71 aa4□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C YAL063C-AQ3E791 96 aa4□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C YMR230W-AQ3E7B5 62 aa4□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C YOR072WQ08486 104 aa3.99□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C MID2P36027 376 aa3.97□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C YFR057WP43625 151 aa3.97□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C YGL230CP53074 147 aa3.97□□□□□ -1.77
SPE3YPR069C YIL134C-AQ45U18 67 aa3.95□□□□□ -1.78
SPE3YPR069C RPL36BO14455 100 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SPE3YPR069C SSS1P35179 80 aa3.94□□□□□ -1.78
SPE3YPR069C YHL005CP38752 130 aa3.94□□□□□ -1.78
SPE3YPR069C MSL1P40567 111 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
SPE3YPR069C SFT1P43682 97 aa3.94□□□□□ -1.78
SPE3YPR069C COA6Q3E846 104 aa3.94□□□□□ -1.78
SPE3YPR069C BET1P22804 142 aa3.93□□□□□ -1.78
SPE3YPR069C YNL184CP53876 108 aa3.92□□□□□ -1.78
SPE3YPR069C YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
SPE3YPR069C SEN15Q04675 128 aa3.92□□□□□ -1.78
SPE3YPR069C PAU23Q07987 124 aa3.92□□□□□ -1.78
SPE3YPR069C YHR130CP38834 111 aa3.91□□□□□ -1.78
SPE3YPR069C YOR034C-AQ3E735 80 aa3.91□□□□□ -1.78
SPE3YPR069C YDL157CQ12082 118 aa3.9□□□□□ -1.79
SPE3YPR069C YHR139C-AO13536 103 aa3.89□□□□□ -1.79
SPE3YPR069C MSA2P36157 363 aa3.89□□□□□ -1.79
SPE3YPR069C CGR1P53188 120 aa3.89□□□□□ -1.79
SPE3YPR069C COX7P10174 60 aa3.87□□□□□ -1.79
SPE3YPR069C OST2P46964 130 aa3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.6 ms