RNA–Protein interactions for RNA: YOL076W

MDM20, Transcript of Non-catalytic subunit of the NatB N-terminal acetyltransferase, yeast

Gene MDM20, Length 2,391 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM20	YOL076W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	RPB11	P38902	120 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	IMP2	P46972	177 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	COA4	Q05809	96 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	YLR162W	Q06235	118 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	MRP17	P28778	131 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	YHL042W	P38729	150 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	YAL064W	P39711	94 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	SPI1	P40092	148 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	LCL2	Q08045	131 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	RTC6	O14464	93 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	YBR013C	P38215	129 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	YGL230C	P53074	147 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	AVO2	Q04749	426 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MDM20	YOL076W	VAR1	P02381	398 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	PAU21	P0CE86	164 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	PAU22	P0CE87	164 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	BRP1	P53194	125 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YGR164W	P53291	111 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YCL001W-A	P87012	153 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	HAP3	P13434	144 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YGL010W	P25338	174 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	LCL1	Q02786	101 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	GPI19	Q04082	140 aa		0.96	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YCR001W	P25347	104 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	HSP10	P38910	106 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	EMC5	P40540	141 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	PAM16	P42949	149 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	DCV1	P43595	202 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	ERV14	P53173	138 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	FYV7	Q12247	151 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	SEC59	P20048	519 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	SWM2	P40342	146 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	FUN14	P18411	198 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	TOM7	P53507	60 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	PFY1	P07274	126 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YKL044W	P36092	106 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YAR029W	P39549	74 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YEL008W	P40001	126 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	MIC27	P50945	234 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YBR090C	P38253	122 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YGL149W	P53116	101 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YLR296W	Q05898	108 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YBR027C	P38220	110 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	TDA2	P40045	126 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	QCR9	P22289	66 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YBR242W	P38331	238 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	GTT1	P40582	234 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YMR082C	Q04276	118 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	IRC21	Q04772	201 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	UBC5	P15732	148 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YER187W	P40102	141 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YFL065C	P43539	102 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YLR194C	Q05777	254 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	COA2	Q3E823	68 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	OST5	Q92316	86 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDM20	YOL076W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YEA6	P39953	335 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	VMA21	P41806	77 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YGR025W	P53216	100 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	PMP3	P87284	55 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YDR029W	Q12111	104 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YHR173C	P38864	112 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	HUR1	P45820	110 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YJL009W	P47078	108 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YMR122C	Q03879	124 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	ZEO1	Q08245	113 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	DAD1	Q12248	94 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	PCC1	Q3E833	88 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YBR292C	P38357	123 aa		0.89	□□□□□ -2.27

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