RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	PGU1	P47180	361 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	YNL190W	P53872	204 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	IRA2	P19158	3079 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	SPI1	P40092	148 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	BLM10	P43583	2143 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	ATP15	P21306	62 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	YFL019C	P43576	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	DCV1	P43595	202 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	YOL014W	Q08110	124 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	RPS27B	P38711	82 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	HUR1	P45820	110 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	YGL193C	P53097	103 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	YML122C	Q03207	126 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	PPT2	Q12036	173 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	RRT15	Q3E811	62 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	YHR022C	P38763	256 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	CTR2	P38865	189 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		4.15	□□□□□ -1.74
UBX2	YML013W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	CCW14	O13547	238 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	MRPS12	P53732	153 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	ICY1	Q04329	127 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	REE1	P40893	198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	PIR5	P46999	287 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	IMP2	P46972	177 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	ATP20	Q12233	115 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	SHU1	P38751	150 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	IGD1	P43598	195 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	IRC21	Q04772	201 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	ECM19	Q06011	112 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	RRT1	P38192	103 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UBX2	YML013W	ICS3	P47034	131 aa		4.09	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YCR043C	P25361	127 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	KRE9	P39005	276 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	MIG3	P39943	394 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	GAT4	P40569	121 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	FYV12	Q08559	129 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	RPB9	P27999	122 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
UBX2	YML013W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	RSM18	P40033	138 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YJR146W	P47174	117 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YDR274C	P87283	123 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	SRL1	Q08673	210 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YAL065C	O13511	128 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	QCR8	P08525	94 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YKR045C	P36138	183 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	RGM1	Q00453	211 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YOR314W	Q12506	109 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YHR125W	P38831	101 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YER084W	P40057	128 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	YIL086C	P40503	102 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UBX2	YML013W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
UBX2	YML013W	YLR162W	Q06235	118 aa		4.02	□□□□□ -1.77
UBX2	YML013W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
UBX2	YML013W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.02	□□□□□ -1.77
UBX2	YML013W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
UBX2	YML013W	ATP18	P81450	59 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UBX2	YML013W	IRA1	P18963	3092 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX2	YML013W	CSF1	Q12150	2958 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX2	YML013W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		4	□□□□□ -1.77
UBX2	YML013W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
UBX2	YML013W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
UBX2	YML013W	TDA2	P40045	126 aa		4	□□□□□ -1.77

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