RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIR3	YKL163W	NRG2	P38082	220 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	YER187W	P40102	141 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	YJR146W	P47174	117 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	DAN1	P47178	298 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	YGL149W	P53116	101 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	BRP1	P53194	125 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	COA4	Q05809	96 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	EMC6	Q12431	108 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	CYT2	Q00873	224 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	YMR082C	Q04276	118 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	ELP6	Q04868	273 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	FIT2	Q08906	153 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	YPL261C	Q08976	102 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	PAI3	P01094	68 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	FUN14	P18411	198 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	AUA1	P32450	94 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	YEL014C	P39999	101 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	CYB5	P40312	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	SWM2	P40342	146 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	EMC5	P40540	141 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	YJL144W	P47009	104 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	HOR7	Q05827	59 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	OST5	Q92316	86 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PIR3	YKL163W	DSE2	P38844	325 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	AGA2	P32781	87 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	VPS55	P47111	140 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	MIX17	Q03667	156 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	YLR296W	Q05898	108 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	UTR5	P32630	166 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	PRM3	Q08931	133 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	RTC6	O14464	93 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	YCR085W	P25650	117 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	RPB7	P34087	171 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	YFL065C	P43539	102 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	SNN1	P48232	102 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	YPR203W	Q08994	102 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	SSS1	P35179	80 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	CWP2	P43497	92 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	PAU12	P53343	120 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	PCC1	Q3E833	88 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	TOM6	P33448	61 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	YKR045C	P36138	183 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	2.66	□□□□□ -1.98	not detected
PIR3	YKL163W	HPA2	Q06592	156 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PIR3	YKL163W	PFY1	P07274	126 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	YHL005C	P38752	130 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	AVO2	Q04749	426 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	ENV10	Q99382	181 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	PAU19	P0CE85	124 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	PAU3	P25610	124 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	PAU2	P32612	120 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	YBR013C	P38215	129 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	YDR042C	Q03205	200 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	SEN15	Q04675	128 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	MPC2	P38857	129 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	RSM18	P40033	138 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		2.63	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	QCR8	P08525	94 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	YHR213W	P0CI67	198 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	ATX1	P38636	73 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	YLR194C	Q05777	254 aa		2.62	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	PAU24	P38155	120 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	YBR027C	P38220	110 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	RGM1	Q00453	211 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	PAU23	Q07987	124 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	PAU17	Q12370	124 aa		2.61	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	COX9	P07255	59 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	ROX3	P25046	220 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	PAU16	P35994	123 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	COX23	P38824	151 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	POR2	P40478	281 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	PAU15	P40585	124 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	YOL118C	Q08259	102 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	VAM10	Q08474	114 aa		2.6	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	MRP17	P28778	131 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PIR3	YKL163W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PIR3	YKL163W	LST8	P41318	303 aa		2.58	□□□□□ -2
PIR3	YKL163W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		2.58	□□□□□ -2
PIR3	YKL163W	RRT15	Q3E811	62 aa		2.58	□□□□□ -2
PIR3	YKL163W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PIR3	YKL163W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		2.57	□□□□□ -2
PIR3	YKL163W	ICY1	Q04329	127 aa		2.57	□□□□□ -2
PIR3	YKL163W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		2.57	□□□□□ -2
PIR3	YKL163W	MIC27	P50945	234 aa		2.56	□□□□□ -2
PIR3	YKL163W	COX12	Q01519	83 aa		2.56	□□□□□ -2
PIR3	YKL163W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PIR3	YKL163W	PRM7	Q12459	698 aa		2.56	□□□□□ -2

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