RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W YNL194CP40169 301 aa4□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YIR020CP40575 100 aa4□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W VPS55P47111 140 aa4□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W TOS8P53147 276 aa4□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YGL088WP53151 121 aa4□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W VMA11P32842 164 aa3.99□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YEL008WP40001 126 aa3.99□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W RRT13P40042 185 aa3.99□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W AIM19P40502 157 aa3.99□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W QCR8P08525 94 aa3.98□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W CAX4P53223 239 aa3.98□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YGR039WP53225 103 aa3.98□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W COX12Q01519 83 aa3.98□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YPL278CQ08990 100 aa3.98□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YHR139C-AO13536 103 aa3.97□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W HUR1P45820 110 aa3.97□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YMR244WQ04018 355 aa3.97□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa3.97□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W YAL067W-AQ8TGK6 75 aa3.97□□□□□ -1.77
VHS1YDR247W CWP2P43497 92 aa3.96□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W YFR035CP43608 114 aa3.96□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W HOR7Q05827 59 aa3.96□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W YDR119W-AQ2V2P9 66 aa3.96□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W YIR021W-AQ3E739 70 aa3.96□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W ENV10Q99382 181 aa3.96□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W YIL059CP40520 121 aa3.95□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W MRPS8Q03799 155 aa3.95□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W SVP26P38869 228 aa3.94□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W RGM1Q00453 211 aa3.94□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W COF1Q03048 143 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W MSA2P36157 363 aa3.93□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W MPC2P38857 129 aa3.93□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W SPG4Q04438 115 aa3.93□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W YHL042WP38729 150 aa3.92□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W PMP3P87284 55 aa3.92□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W YMR295CQ03559 197 aa3.92□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W YOR034C-AQ3E735 80 aa3.92□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W RAD6P06104 172 aa3.91□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W UBC5P15732 148 aa3.91□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data3.91□□□□□ -1.78not detected
VHS1YDR247W ECM19Q06011 112 aa3.91□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W YDR029WQ12111 104 aa3.9□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W EMC6Q12431 108 aa3.9□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W TAR1Q8TGM6 124 aa3.9□□□□□ -1.78
VHS1YDR247W YBR219CP38317 127 aa3.89□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W KNH1P50112 268 aa3.89□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W SHH4Q06236 168 aa3.89□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa3.89□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W YOR020W-AQ3E824 90 aa3.89□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W YBR056W-AI2HB52 66 aa3.89□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W YAR029WP39549 74 aa3.89□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W VAM10Q08474 114 aa3.89□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W YLR361C-AQ3E795 98 aa3.89□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W YLL006W-AQ3E814 58 aa3.89□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W YLR236CA0A023PZG4 107 aa3.88□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W ECM12O13529 151 aa3.87□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W YJR107C-AP0CT86 78 aa3.87□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W RPB9P27999 122 aa3.87□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W ALG13P53178 202 aa3.87□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.87□□□□□ -1.79not detected
VHS1YDR247W URA2P07259 2214 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W TOM6P33448 61 aa3.86□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W YSY6P38374 65 aa3.86□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W Q0297Q9ZZV8 51 aa3.86□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W IRC21Q04772 201 aa3.85□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W MPC3P53311 146 aa3.84□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W YLR285C-AQ3E771 56 aa3.84□□□□□ -1.79
VHS1YDR247W EDC1P53080 175 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YMR122W-AQ3E842 84 aa3.83□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W TOR2P32600 2474 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YAL065CO13511 128 aa3.82□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W ATP18P81450 59 aa3.82□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W ICY1Q04329 127 aa3.82□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YER039C-AP0CD97 72 aa3.81□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YHR212W-AP0CX91 67 aa3.81□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YLR156WP0CE96 114 aa3.8□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YLR159WP0CE97 114 aa3.8□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YLR161WP0CE98 114 aa3.8□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YER187WP40102 141 aa3.8□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YGR240C-AQ3E786 66 aa3.8□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YCR001WP25347 104 aa3.79□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YCR050CP25630 102 aa3.79□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W GAT4P40569 121 aa3.79□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W ERI1P62651 68 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YBL081WP38180 368 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YDL241WQ07738 123 aa3.78□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YMR175W-AQ3E766 64 aa3.78□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W TEL1P38110 2787 aa3.78□□□□□ -1.8
VHS1YDR247W YFR009W-AP0C5M9 85 aa3.77□□□□□ -1.81
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