RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 COMMD8Q9NX08 183 aa28.35■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 CLDN5O00501 218 aa28.34■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 OLFM2O95897 454 aa28.34■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 YWHAQP27348 245 aa28.34■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 GTF2H1P32780 548 aa28.34■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 CACNA2D1P54289 1103 aa28.34■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 NR1H3Q13133 447 aa28.34■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 Q6ZS52 159 aa28.34■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 CRYBG2Q8N1P7 616 aa28.34■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 TMEM30AQ9NV96 361 aa28.34■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 ATG13O75143 517 aa28.33■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 DRD1P21728 446 aa28.33■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 HOXA6P31267 233 aa28.33■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 ASPAP45381 313 aa28.33■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 EML3Q32P44 896 aa28.33■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 CCDC150Q8NCX0 1101 aa28.33■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 GSDMAQ96QA5 445 aa28.33■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 DNAI2Q9GZS0 605 aa28.33■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 CYP3A43Q9HB55 503 aa28.33■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 MYH10P35580 1976 aa28.33■■■□□ 2.13
ODC1-204ENST00000446285 NFATC1O95644 943 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 OAS1P00973 400 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 CNR2P34972 360 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 GJA4P35212 333 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 NDST1P52848 882 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 FBXO43Q4G163 708 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 FSTL4Q6MZW2 842 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 PAQR9Q6ZVX9 377 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 ACOT1Q86TX2 421 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 FBXO32Q969P5 355 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 CHFRQ96EP1 664 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 TMEM8AQ9HCN3 771 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 NCDNQ9UBB6 729 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 WNT6Q9Y6F9 365 aa28.32■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 SMC2O95347 1197 aa28.31■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 GCLMP48507 274 aa28.31■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 INCA1Q0VD86 236 aa28.31■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 COBLL1Q53SF7 1204 aa28.31■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 FUKQ8N0W3 1084 aa28.31■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 FAXDC2Q96IV6 333 aa28.31■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 P2RY13Q9BPV8 354 aa28.31■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 IL37Q9NZH6 218 aa28.31■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 K7ESF4 209 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 LEFTY2O00292 366 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 CETN3O15182 167 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 STX10O60499 249 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 AP1G2O75843 785 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 ABL1P00519 1130 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 TRIM49P0CI25 452 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 TRIM49CP0CI26 452 aa28.3■■■□□ 2.12
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ODC1-204ENST00000446285 SPOPLQ6IQ16 392 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 LONP2Q86WA8 852 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 TTC16Q8NEE8 873 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 CCDC26Q8TAB7 109 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 TIGD1Q96MW7 591 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 KCNK16Q96T55 309 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 KRT82Q9NSB4 513 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 RAB23Q9ULC3 237 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 TNFRSF10BO14763 440 aa28.29■■■□□ 2.12
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ODC1-204ENST00000446285 TUBP50607 506 aa28.29■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 SLC5A3P53794 718 aa28.29■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
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ODC1-204ENST00000446285 KRT39Q6A163 491 aa28.29■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 TAS1R2Q8TE23 839 aa28.29■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 ELMO3Q96BJ8 720 aa28.29■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 NIF3L1Q9GZT8 377 aa28.29■■■□□ 2.12
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ODC1-204ENST00000446285 CPQQ9Y646 472 aa28.29■■■□□ 2.12
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ODC1-204ENST00000446285 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa28.28■■■□□ 2.12
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ODC1-204ENST00000446285 TTC39CQ8N584 583 aa28.28■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 ENGASEQ8NFI3 743 aa28.28■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 SLC2A14Q8TDB8 520 aa28.28■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 CD101Q93033 1021 aa28.28■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 TSG101Q99816 390 aa28.28■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 NT5C1AQ9BXI3 368 aa28.28■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 FBXO44Q9H4M3 255 aa28.28■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 ZXDBP98169 803 aa28.27■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 HECTD3Q5T447 861 aa28.27■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 HMGXB4Q9UGU5 601 aa28.27■■■□□ 2.12
ODC1-204ENST00000446285 GMEB2Q9UKD1 530 aa28.27■■■□□ 2.12
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