RNA–Protein interactions for RNA: YPR036W

VMA13, Transcript of Subunit H of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA13, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA13	YPR036W	LST8	P41318	303 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VMA13	YPR036W	YNR064C	P53750	290 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VMA13	YPR036W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VMA13	YPR036W	SEN15	Q04675	128 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VMA13	YPR036W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VMA13	YPR036W	MRPL44	P19956	98 aa		4.21	□□□□□ -1.73
VMA13	YPR036W	CYB5	P40312	120 aa		4.21	□□□□□ -1.73
VMA13	YPR036W	HUA1	P40325	198 aa		4.21	□□□□□ -1.73
VMA13	YPR036W	YIL059C	P40520	121 aa		4.21	□□□□□ -1.73
VMA13	YPR036W	YFL019C	P43576	117 aa		4.21	□□□□□ -1.73
VMA13	YPR036W	HAP3	P13434	144 aa		4.21	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YGL010W	P25338	174 aa		4.21	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	GPI18	P38211	433 aa		4.21	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	TEM1	P38987	245 aa		4.21	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YFR045W	P43617	309 aa		4.21	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	CYT2	Q00873	224 aa		4.21	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	ATX2	Q12067	313 aa		4.21	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	TIM22	Q12328	207 aa		4.21	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.21	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YBL071C	P38185	102 aa		4.2	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	ERV14	P53173	138 aa		4.2	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	IRC25	Q07951	179 aa		4.2	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	MSA2	P36157	363 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YHR173C	P38864	112 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	NCA3	P46955	337 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YJL028W	P47062	111 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	FIT2	Q08906	153 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	VMA11	P32842	164 aa		4.18	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	PAM17	P36147	197 aa		4.18	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YER134C	P40081	178 aa		4.18	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	TOM7	P53507	60 aa		4.18	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	JID1	Q12350	301 aa		4.18	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.17	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YIR020C	P40575	100 aa		4.17	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	SPG1	P50088	95 aa		4.17	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	IRC23	Q08416	157 aa		4.17	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.17	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	AYT1	Q12226	474 aa		4.17	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.17	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	TRP1	P00912	224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	ATP15	P21306	62 aa		4.16	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	CSI2	Q08054	341 aa		4.16	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	FZF1	P32805	299 aa		4.15	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.74	not detected
VMA13	YPR036W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	ATP19	P81451	68 aa		4.15	□□□□□ -1.74
VMA13	YPR036W	YCR050C	P25630	102 aa		4.14	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	IMP2	P46972	177 aa		4.14	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.13	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.13	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	HOT13	P36078	116 aa		4.13	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	RRT1	P38192	103 aa		4.13	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	YER135C	P40082	130 aa		4.13	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	BPH1	P25356	2167 aa		4.13	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	YMR141C	P40211	102 aa		4.12	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	YML122C	Q03207	126 aa		4.12	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	FYV12	Q08559	129 aa		4.12	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	COA6	Q3E846	104 aa		4.12	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	FUN14	P18411	198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	DAD4	P69851	72 aa		4.12	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.12	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	YFL067W	P43537	175 aa		4.11	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.11	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.11	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
VMA13	YPR036W	YGR025W	P53216	100 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VMA13	YPR036W	YAL064W	P39711	94 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VMA13	YPR036W	YGL118C	P53132	145 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VMA13	YPR036W	DAD1	Q12248	94 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VMA13	YPR036W	RPR2	P40571	144 aa		4.07	□□□□□ -1.76
VMA13	YPR036W	BRP1	P53194	125 aa		4.07	□□□□□ -1.76
VMA13	YPR036W	YDR274C	P87283	123 aa		4.07	□□□□□ -1.76
VMA13	YPR036W	HAL1	Q01766	294 aa		4.07	□□□□□ -1.76
VMA13	YPR036W	ATP20	Q12233	115 aa		4.07	□□□□□ -1.76
VMA13	YPR036W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
VMA13	YPR036W	ECM12	O13529	151 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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