RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	ALG13	P53178	202 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YMR320W	Q04897	101 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YBR090C	P38253	122 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YFR057W	P43625	151 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	SBH2	P52871	88 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YPL080C	Q02826	108 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YJL118W	P47022	219 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	MIG1	P27705	504 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	IES6	P32617	166 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	RRT13	P40042	185 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YGR219W	P53307	113 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.15	□□□□□ -1.9	not detected
RPO31	YOR116C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YGR269W	P40326	108 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YDR114C	Q04597	100 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	PIR5	P46999	287 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YGL088W	P53151	121 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	TOS8	P53147	276 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	AIM34	Q03673	198 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YPL229W	Q99395	206 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YLR415C	O13578	112 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	ATP15	P21306	62 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YCR006C	P25350	157 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	MSA2	P36157	363 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YAR068W	P39564	161 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	SPG1	P50088	95 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	ERS1	P17261	260 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	MID2	P36027	376 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	ATP20	Q12233	115 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	SVP26	P38869	228 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	TOS6	P48560	102 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YGR164W	P53291	111 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	SPG4	Q04438	115 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	RPS27B	P38711	82 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	HUA1	P40325	198 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	ATG33	Q06485	197 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YFL019C	P43576	117 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	VAM10	Q08474	114 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YFR054C	P43622	192 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YNL234W	P53857	426 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	VMA3	P25515	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	RSM18	P40033	138 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YCH1	P42937	148 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	CRC1	Q12289	327 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	MIC12	P38341	106 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	MPC3	P53311	146 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	SMP1	P38128	452 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	FLO9	P39712	1322 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	ERG28	P40030	148 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	RXT3	Q07458	294 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	SAP30	P38429	201 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YER187W	P40102	141 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	OST5	Q92316	86 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	MOH1	P38191	138 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	SHH4	Q06236	168 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	not detected
RPO31	YOR116C	PCP1	P53259	346 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YNL194C	P40169	301 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	CCW12	Q12127	133 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	SDH6	Q3E785	79 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPO31	YOR116C	PGU1	P47180	361 aa		3.09	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	BRP1	P53194	125 aa		3.09	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	SRL1	Q08673	210 aa		3.09	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		3.09	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	ICY1	Q04329	127 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	3.08	□□□□□ -1.92	not detected
RPO31	YOR116C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	RPL39	P04650	51 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YBL039W-B	P0C268	59 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92

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