RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeastyeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9YOL089C MVB12P42939 101 aa-0.23□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C LSM8P47093 109 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C PKR1Q03880 122 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C UTP10P42945 1769 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C EMP24P32803 203 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data-0.23□□□□□ -2.45not detected
HAL9YOL089C YDR366CP87287 132 aa-0.23□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C TSC11P40061 1430 aa-0.24□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C HAP3P13434 144 aa-0.24□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C PRS3P38689 320 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C VMA10P48836 114 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C GRX3Q03835 250 aa-0.24□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C GAT4P40569 121 aa-0.24□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C MIC27P50945 234 aa-0.24□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C YIL014C-AQ02598 104 aa-0.24□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C YDR278CQ05612 105 aa-0.24□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C KRE5P22023 1365 aa-0.25□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C JIP3O13555 125 aa-0.25□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C YGR240C-AQ3E786 66 aa-0.25□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C AIM18P38884 321 aa-0.25□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C POR2P40478 281 aa-0.25□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C COX19Q3E731 98 aa-0.25□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C YGR201CP42936 225 aa-0.26□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C VPS55P47111 140 aa-0.26□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C YGR039WP53225 103 aa-0.26□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C COF1Q03048 143 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C MEC1P38111 2368 aa-0.26□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C YIL163CP40448 117 aa-0.26□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C YFR035CP43608 114 aa-0.26□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C SLO1Q3E784 85 aa-0.26□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa-0.26□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C MED11Q99278 115 aa-0.26□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C ATX1P38636 73 aa-0.27□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C HPM1P40481 377 aa-0.27□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C YBR072C-AQ3E794 53 aa-0.27□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C LAA1P39526 2014 aa-0.27□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C CSF1Q12150 2958 aa-0.27□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C AUA1P32450 94 aa-0.27□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C GTT2Q12390 233 aa-0.27□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C CCW14O13547 238 aa-0.28□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C Q0144Q9ZZW2 109 aa-0.28□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C RPL36BO14455 100 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C PHS1P40857 217 aa-0.28□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C YCL001W-AP87012 153 aa-0.28□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa-0.28□□□□□ -2.45
HAL9YOL089C YCR050CP25630 102 aa-0.29□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C UTP11P34247 250 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C SRX1P36077 127 aa-0.29□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YEA6P39953 335 aa-0.29□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C LCL1Q02786 101 aa-0.29□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YGL041C-BQ3E750 60 aa-0.29□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C SUA7P29055 345 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C RPS1AP33442 255 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C HSP10P38910 106 aa-0.29□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C RPL22AP05749 121 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C LDB18Q07887 179 aa-0.3□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C STT4P37297 1900 aa-0.3□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C RPS20P38701 121 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YIR020CP40575 100 aa-0.3□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YDR210WQ03482 75 aa-0.3□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C MRPS12P53732 153 aa-0.31□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C ELC1Q03071 99 aa-0.31□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YMR320WQ04897 101 aa-0.31□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YAL064WP39711 94 aa-0.31□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C EFM5P53200 248 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YGR164WP53291 111 aa-0.31□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YNL190WP53872 204 aa-0.31□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C OST5Q92316 86 aa-0.32□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C ADK1P07170 222 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C CYC2P38909 366 aa-0.32□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C RBL2P48606 106 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YIL086CP40503 102 aa-0.32□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YGL204CP53089 101 aa-0.32□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YGL149WP53116 101 aa-0.32□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C SFT1P43682 97 aa-0.33□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C TRA1P38811 3744 aa-0.33□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C GIM4P40005 111 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C ERV14P53173 138 aa-0.33□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C CNL1Q06333 122 aa-0.33□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C HKR1P41809 1802 aa-0.33□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C SEC59P20048 519 aa-0.34□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YHR173CP38864 112 aa-0.34□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YER187WP40102 141 aa-0.34□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C GPI19Q04082 140 aa-0.34□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C MOG1P47123 218 aa-0.34□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YLR255CO13574 117 aa-0.34□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C RPL14AP36105 138 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C RPL14BP38754 138 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C RPL22BP56628 122 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.46
HAL9YOL089C YCR099CP25657 155 aa-0.35□□□□□ -2.47
HAL9YOL089C HPA2Q06592 156 aa-0.35□□□□□ -2.47
HAL9YOL089C YBR016WP38216 128 aa-0.36□□□□□ -2.47
HAL9YOL089C GCV3P39726 170 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
HAL9YOL089C SMD2Q06217 110 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.1 ms