RNA–Protein interactions for RNA: YNL108C

YNL108C, Transcript of Protein phosphatase, yeast

Gene YNL108C, Length 813 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL108C	YNL108C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	GDB1	Q06625	1536 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	YHR180W	P38868	163 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	YFL051C	P43552	160 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	YOL085C	Q99345	113 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	YPI1	P43587	155 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	YOR268C	Q08734	132 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	STU1	P38198	1513 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	UBR1	P19812	1950 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	PAU5	P43575	122 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	SNA2	P56508	79 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	ROX3	P25046	220 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	MRPS9	P38120	278 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	SEC11	P15367	167 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	COX23	P38824	151 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	CIS3	P47001	227 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	YLR194C	Q05777	254 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	VTH1	P40438	1549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	VTH2	P40890	1549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL108C	YNL108C	RTC6	O14464	93 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	UFD4	P33202	1483 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	VPS68	Q12016	184 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	YIR020C	P40575	100 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	YNR077C	P53758	84 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	YOR314W	Q12506	109 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	FLO11	P08640	1367 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	PFY1	P07274	126 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	YEL014C	P39999	101 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	DOP1	Q03921	1698 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	QCR8	P08525	94 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	YMR321C	Q04898	105 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	PDR12	Q02785	1511 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	COX8	P04039	78 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	POR2	P40478	281 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL108C	YNL108C	HSP150	P32478	413 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	PRM7	Q12459	698 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	LAA1	P39526	2014 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	LST8	P41318	303 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	YPR195C	Q06594	109 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	MYO1	P08964	1928 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	YAL065C	O13511	128 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	YSY6	P38374	65 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	ULS1	Q08562	1619 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	QCR9	P22289	66 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	TIM12	P32830	109 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	YBR027C	P38220	110 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	SPC1	P46965	94 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	IRC21	Q04772	201 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	YHR007C-A	Q07074	71 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	BCK1	Q01389	1478 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	FPR2	P32472	135 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	YLR422W	Q06409	1932 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	GSC2	P40989	1895 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	YHL037C	P38733	133 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	MPC2	P38857	129 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL108C	YNL108C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL108C	YNL108C	YHR173C	P38864	112 aa		3.96	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.6 ms