RNA–Protein interactions for RNA: YMR118C

SHH3, Transcript of Putative mitochondrial inner membrane protein of unknown function, yeast

Gene SHH3, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHH3	YMR118C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	NRG2	P38082	220 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	PEX17	P40155	199 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YIA6	P40556	373 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	DCV1	P43595	202 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	KEG1	P43614	200 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	Q0255	P03881	472 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	RAD6	P06104	172 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	UGX2	P32772	223 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	MID2	P36027	376 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YJR146W	P47174	117 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YNL190W	P53872	204 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YHR022C	P38763	256 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	AIM19	P40502	157 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	VPS55	P47111	140 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YDL186W	P48568	277 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YGR025W	P53216	100 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YGR039W	P53225	103 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	MRPS12	P53732	153 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	COX12	Q01519	83 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YMR317W	Q04893	1140 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YOL085C	Q99345	113 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	ENV10	Q99382	181 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YHR139C-A	O13536	103 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	MIC12	P38341	106 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	CWP2	P43497	92 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	CCW12	Q12127	133 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	COX17	Q12287	69 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	TRP1	P00912	224 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	QCR8	P08525	94 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	INO2	P26798	304 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	SHU1	P38751	150 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	HUR1	P45820	110 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	BNA1	P47096	177 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	PBA1	Q05778	276 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YLR042C	Q07990	161 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	VMA11	P32842	164 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YHL042W	P38729	150 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YIL059C	P40520	121 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	ECM12	O13529	151 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	DIF1	O13577	133 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	SMP1	P38128	452 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YBR209W	P38311	105 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	MPC2	P38857	129 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YEL008W	P40001	126 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	RRT13	P40042	185 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YNL194C	P40169	301 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	SIM1	P40472	476 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	KNH1	P50112	268 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	SBH2	P52871	88 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YGL088W	P53151	121 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	CAX4	P53223	239 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YDR029W	Q12111	104 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	EMC6	Q12431	108 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	BLM10	P43583	2143 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YLR415C	O13578	112 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	MSA2	P36157	363 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YER135C	P40082	130 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	TOS8	P53147	276 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	PPT2	Q12036	173 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YPR013C	Q12145	317 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	SVP26	P38869	228 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YCH1	P42937	148 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YGL260W	P53056	76 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	RGM1	Q00453	211 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	SHH4	Q06236	168 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	TOM6	P33448	61 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YSY6	P38374	65 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	MIG3	P39943	394 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	2.61	□□□□□ -1.99	not detected
SHH3	YMR118C	PMP3	P87284	55 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	MRPS8	Q03799	155 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YMR244W	Q04018	355 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SHH3	YMR118C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		2.61	□□□□□ -1.99

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40.6 ms