RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W YCL001W-AP87012 153 aa2.9□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YMR103CQ04436 120 aa2.9□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YMR252CQ04814 134 aa2.9□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YPR013CQ12145 317 aa2.9□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YCR075W-AQ3E830 75 aa2.9□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YLR236CA0A023PZG4 107 aa2.89□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W RPL39P04650 51 aa2.89□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YHL042WP38729 150 aa2.89□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YOR385WQ08909 290 aa2.89□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W ATG41Q12048 136 aa2.89□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W INO4P13902 151 aa2.88□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W MRPL44P19956 98 aa2.88□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W ERV15P38312 142 aa2.88□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YHR130CP38834 111 aa2.88□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W CCS1P40202 249 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YIL059CP40520 121 aa2.88□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W PIR5P46999 287 aa2.88□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W HRT1Q08273 121 aa2.88□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W MED11Q99278 115 aa2.88□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W COX5BP00425 151 aa2.87□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W MIG1P27705 504 aa2.87□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W SRB6P32570 121 aa2.87□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W ECM31P38122 312 aa2.87□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W ERG25P53045 309 aa2.87□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W FIT1Q04433 528 aa2.87□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W SOM1Q05676 74 aa2.87□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W QCR10P37299 77 aa2.86□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W IPT1P38954 527 aa2.86□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YGR269WP40326 108 aa2.86□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W SCP1Q08873 200 aa2.86□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W FEX1Q08913 375 aa2.86□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W FEX2Q08991 375 aa2.86□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W RAD28Q12021 506 aa2.86□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YEL067CP39978 195 aa2.85□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W ERV14P53173 138 aa2.85□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W GPI19Q04082 140 aa2.85□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W NMA1Q06178 401 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YDL157CQ12082 118 aa2.85□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YGL194C-AQ2V2P6 80 aa2.85□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YKL044WP36092 106 aa2.84□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W SNF11P38956 169 aa2.84□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W TDA2P40045 126 aa2.84□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YFR035CP43608 114 aa2.84□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YOR376W-AQ3E805 51 aa2.84□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W SEC11P15367 167 aa2.83□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W YGL010WP25338 174 aa2.83□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W FMT1P32785 401 aa2.83□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W DAD4P69851 72 aa2.83□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W YDL241WQ07738 123 aa2.83□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W NAT5Q08689 176 aa2.83□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W COA6Q3E846 104 aa2.83□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W SVP26P38869 228 aa2.82□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W HSP10P38910 106 aa2.82□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W KNH1P50112 268 aa2.82□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W YPR195CQ06594 109 aa2.82□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W YLR365WQ7LIF2 110 aa2.82□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W FYV5P25585 152 aa2.81□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W YOS1Q3E834 85 aa2.81□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W UBC4P15731 148 aa2.8□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W YPR153WQ06537 140 aa2.8□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W MHF2Q3E829 80 aa2.8□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa2.8□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W ECM12O13529 151 aa2.79□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W COX8P04039 78 aa2.79□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W PAU21P0CE86 164 aa2.79□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W PAU22P0CE87 164 aa2.79□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W VMA21P41806 77 aa2.79□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W POP3P53833 195 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W YPL067CQ02754 198 aa2.79□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa2.79□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W STF2P16965 84 aa2.78□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W KRE1P17260 313 aa2.78□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W EMP24P32803 203 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W HPA3P39979 161 aa2.78□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W HUR1P45820 110 aa2.78□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W GPI11Q06636 219 aa2.78□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W YDR029WQ12111 104 aa2.78□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W KSH1Q8TGJ3 72 aa2.78□□□□□ -1.96
PIR3YKL163W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
PIR3YKL163W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
PIR3YKL163W YHR022CP38763 256 aa2.76□□□□□ -1.97
PIR3YKL163W SPO73P40031 143 aa2.76□□□□□ -1.97
PIR3YKL163W MSL1P40567 111 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PIR3YKL163W DCV1P43595 202 aa2.76□□□□□ -1.97
PIR3YKL163W RSM19P53733 91 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PIR3YKL163W YHR007C-AQ07074 71 aa2.76□□□□□ -1.97
PIR3YKL163W DAD1Q12248 94 aa2.76□□□□□ -1.97
PIR3YKL163W SUS1Q6WNK7 96 aa2.76□□□□□ -1.97
PIR3YKL163W MIC10Q96VH5 97 aa2.76□□□□□ -1.97
PIR3YKL163W YHR212W-AP0CX91 67 aa2.75□□□□□ -1.97
PIR3YKL163W HMRA1P0CY11 126 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.7 ms