RNA–Protein interactions for RNA: YJR055W

HIT1, Transcript of Protein involved in C/D snoRNP assembly, yeast

Gene HIT1, Length 495 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HIT1	YJR055W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	YJL009W	P47078	108 aa		0.39	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	MGR2	Q02889	113 aa		0.39	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		0.39	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	MHF2	Q3E829	80 aa		0.39	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		0.39	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	INO4	P13902	151 aa		0.38	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	PHO13	P19881	312 aa		0.38	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	AME1	P38313	324 aa		0.38	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	DLS1	P40366	167 aa		0.38	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	YPD1	Q07688	167 aa		0.38	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	YOL131W	Q08270	108 aa		0.38	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	RIB3	Q99258	208 aa		0.38	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	IPT1	P38954	527 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	SPC1	P46965	94 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	ORM1	P53224	222 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	COA4	Q05809	96 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	YPR153W	Q06537	140 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	HUT1	Q12520	339 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	RRT15	Q3E811	62 aa		0.37	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	RTC6	O14464	93 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	TLG1	Q03322	224 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	IRC21	Q04772	201 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	YOS1	Q3E834	85 aa		0.36	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	AIM19	P40502	157 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	YGR201C	P42936	225 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	GPI2	P46961	280 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	YGR025W	P53216	100 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	SPC3	Q12133	184 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		0.35	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	DER1	P38307	211 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	POR2	P40478	281 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	LST8	P41318	303 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YGL149W	P53116	101 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	EST3	Q03096	181 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	GPI11	Q06636	219 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YOL118C	Q08259	102 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YDR029W	Q12111	104 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		0.34	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	HHY1	P39982	102 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	RAV2	Q03956	351 aa		0.33	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	UBC4	P15731	148 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	SLM6	P38343	150 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	SNF11	P38956	169 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YER181C	P40097	107 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	EMC5	P40540	141 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	GLC8	P41818	229 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	COA6	Q3E846	104 aa		0.32	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YCR101C	P25607	182 aa		0.31	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	SRP21	P32342	167 aa		0.31	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YBR013C	P38215	129 aa		0.31	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YMR141C	P40211	102 aa		0.31	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YLR194C	Q05777	254 aa		0.31	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	NSL1	Q12143	216 aa		0.31	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	DIE2	P50076	525 aa		0.3	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YDR210W	Q03482	75 aa		0.3	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YMR122C	Q03879	124 aa		0.3	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	KTI11	Q3E840	82 aa		0.3	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	PET20	Q99373	253 aa		0.3	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		0.29	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	PFY1	P07274	126 aa		0.29	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		0.29	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	PET54	P10834	293 aa		0.29	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.29	□□□□□ -2.36	not detected
HIT1	YJR055W	IMP2	P46972	177 aa		0.29	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	SPG1	P50088	95 aa		0.29	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	SNA2	P56508	79 aa		0.29	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YMR320W	Q04897	101 aa		0.29	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YLR042C	Q07990	161 aa		0.29	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	SCS22	Q6Q595	175 aa		0.29	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.28	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YBL071C	P38185	102 aa		0.28	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
HIT1	YJR055W	YHR140W	P38842	239 aa		0.28	□□□□□ -2.36

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