RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CYK3	YDL117W	FIG2	P25653	1609 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	ROX3	P25046	220 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YEL045C	P32616	141 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	YAL064W	P39711	94 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CYK3	YDL117W	TIM17	P39515	158 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YFL051C	P43552	160 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YPI1	P43587	155 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YDR274C	P87283	123 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	LDB16	P25587	256 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YHR173C	P38864	112 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YGR050C	P53231	118 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	PPT2	Q12036	173 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	PFY1	P07274	126 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YBR209W	P38311	105 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YHR180W	P38868	163 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	HUR1	P45820	110 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	PBA1	Q05778	276 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	ERG2	P32352	222 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YEL067C	P39978	195 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YGR269W	P40326	108 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	MDM35	O60200	86 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	SRX1	P36077	127 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	SPG1	P50088	95 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	PCP1	P53259	346 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YNR077C	P53758	84 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	FLO9	P39712	1322 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	CCH1	P50077	2039 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	MRPL39	P36533	70 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	CTR2	P38865	189 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	PET8	P38921	284 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YML122C	Q03207	126 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	CRC1	Q12289	327 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YER135C	P40082	130 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YGR018C	P53211	109 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	MTC6	P38849	526 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	SPI1	P40092	148 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	AIM19	P40502	157 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	ECO1	P43605	281 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YHP1	Q04116	353 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CYK3	YDL117W	YAL065C	O13511	128 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	ATP19	P81451	68 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	YOR314W	Q12506	109 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	YHL005C	P38752	130 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	IMP2	P46972	177 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		4	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	PAU7	P39545	55 aa		4	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	FYV5	P25585	152 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	MPC2	P38857	129 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	3.99	□□□□□ -1.77	not detected
CYK3	YDL117W	YLR162W	Q06235	118 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	YOL118C	Q08259	102 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	TIM22	Q12328	207 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	YEL073C	P39974	107 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	YHR022C	P38763	256 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	YPR011C	Q12251	326 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	MIG3	P39943	394 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	DCV1	P43595	202 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	NCA3	P46955	337 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	ATP20	Q12233	115 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	VPS68	Q12016	184 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CYK3	YDL117W	SED1	Q01589	338 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CYK3	YDL117W	YOL029C	Q08187	201 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CYK3	YDL117W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CYK3	YDL117W	OST5	Q92316	86 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CYK3	YDL117W	YLR156W	P0CE96	114 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CYK3	YDL117W	YLR159W	P0CE97	114 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CYK3	YDL117W	YLR161W	P0CE98	114 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CYK3	YDL117W	AGA1	P32323	725 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CYK3	YDL117W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CYK3	YDL117W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CYK3	YDL117W	HUA1	P40325	198 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CYK3	YDL117W	MPC3	P53311	146 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CYK3	YDL117W	YMR122C	Q03879	124 aa		3.95	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.5 ms