RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473154.1

CYCSP20-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 20, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP20, Length 315 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP20-201ENST00000473154 GDF15Q99988 308 aa5.9□□□□□ -1.46
CYCSP20-201ENST00000473154 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.9□□□□□ -1.46
CYCSP20-201ENST00000473154 PCDHAC1Q9H158 963 aa5.9□□□□□ -1.46
CYCSP20-201ENST00000473154 ZBTB26Q9HCK0 441 aa5.9□□□□□ -1.46
CYCSP20-201ENST00000473154 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.9□□□□□ -1.46
CYCSP20-201ENST00000473154 CASS4Q9NQ75 786 aa5.9□□□□□ -1.46
CYCSP20-201ENST00000473154 NECTIN3Q9NQS3 549 aa5.9□□□□□ -1.46
CYCSP20-201ENST00000473154 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.9□□□□□ -1.46
CYCSP20-201ENST00000473154 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CYCSP20-201ENST00000473154 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 PPM1DO15297 605 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 KCNQ3O43525 872 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 ITGAMP11215 1152 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 PDE6CP51160 858 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 TUBA3CQ13748 450 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 PFKFB4Q16877 469 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 CERCAMQ5T4B2 595 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 KCNV1Q6PIU1 500 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 KRT73Q86Y46 540 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 ARHGEF19Q8IW93 802 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 SSH3Q8TE77 659 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 OSCP1Q8WVF1 389 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 TRIM63Q969Q1 353 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 TRIM5Q9C035 493 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 TMOD4Q9NZQ9 345 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 LRFN1Q9P244 771 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 DKK2Q9UBU2 259 aa5.89□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 PIP5K1BO14986 540 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 SNX2O60749 519 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 CSF1RP07333 972 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 PDHA1P08559 390 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 SRGNP10124 158 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 HGFP14210 728 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 ITIH3Q06033 890 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 FOXE3Q13461 319 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 ZACNQ401N2 412 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 PRR16Q569H4 304 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 MANEALQ5VSG8 457 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 RAP1GAP2Q684P5 730 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 ABRAQ8N0Z2 381 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 FAM109AQ8N4B1 249 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 MYCT1Q8N699 235 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 SPATA5Q8NB90 893 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 PROKR1Q8TCW9 393 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 LPIN2Q92539 896 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 LENG9Q96B70 501 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 GPR20Q99678 358 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 PAGR1Q9BTK6 254 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 USP22Q9UPT9 525 aa5.88□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 LGALS16A8MUM7 142 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 EGR1P18146 543 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 MTHFSP49914 203 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 PGDP52209 483 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 SP2Q02086 613 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 SPARCL1Q14515 664 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 PTPAQ15257 358 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 MRNIPQ6NTE8 343 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 SPRED1Q7Z699 444 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 ASB10Q8WXI3 467 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 FAM227BQ96M60 508 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 SCLT1Q96NL6 688 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 WDR11Q9BZH6 1224 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 DACT1Q9NYF0 836 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 IGSF9Q9P2J2 1179 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.87□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 AQP12BA6NM10 295 aa5.86□□□□□ -1.47
CYCSP20-201ENST00000473154 NPC1O15118 1278 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 449.8 ms