RNA–Protein interactions for RNA: YOL059W

GPD2, Transcript of NAD-dependent glycerol 3-phosphate dehydrogenase, yeast

Gene GPD2, Length 1,323 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPD2	YOL059W	APS2	Q00381	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	HAL1	Q01766	294 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	PAU5	P43575	122 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	BRP1	P53194	125 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	DIA1	P54005	336 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	SGF11	Q03067	99 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	VAM10	Q08474	114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	PAU3	P25610	124 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	SDH8	P38345	138 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	SUR2	P38992	349 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	SDS23	P53172	527 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	YDR366C	P87287	132 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	UPS3	Q04006	179 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	DXO1	Q06349	442 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
GPD2	YOL059W	CSM4	Q08955	156 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	IRC22	P40006	225 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	AIM34	Q03673	198 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	YCR023C	P25351	611 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	ZRT1	P32804	376 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	YPT53	P36019	220 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	YHR140W	P38842	239 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	KRE9	P39005	276 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	YNL217W	P40152	326 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	COX16	P47081	118 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	ATP23	P53722	227 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	GPI19	Q04082	140 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	YLR415C	O13578	112 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	YKR032W	P36127	104 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	GTO3	Q04806	366 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GPD2	YOL059W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	MRPL28	P36527	147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	PET8	P38921	284 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	PAU7	P39545	55 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	RPR2	P40571	144 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	ELF1	P36053	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	YCH1	P42937	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	ARL3	Q02804	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	DGA1	Q08650	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	SSS1	P35179	80 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	YGR149W	P48236	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	TVP18	Q04767	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	CRC1	Q12289	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	CYT2	Q00873	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	POM33	Q12164	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	GAT4	P40569	121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPD2	YOL059W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	UBC5	P15732	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	DCV1	P43595	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	CGR1	P53188	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	DPP1	Q05521	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	YPR195C	Q06594	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	COA6	Q3E846	104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	SAL1	D6W196	494 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	TEM1	P38987	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	YGL088W	P53151	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	YER076C	P40049	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	OST3	P48439	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	PMP3	P87284	55 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	PBA1	Q05778	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPD2	YOL059W	YBR209W	P38311	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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