RNA–Protein interactions for RNA: YML027W

YOX1, Transcript of Homeobox transcriptional repressor, yeast

Gene YOX1, Length 1,158 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOX1	YML027W	YFL067W	P43537	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	DXO1	Q06349	442 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	YBR090C	P38253	122 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	CSM4	Q08955	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	MSK1	P32048	576 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	SRP21	P32342	167 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
YOX1	YML027W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	YGR017W	P53210	297 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	MRP49	P32388	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	ERG28	P40030	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	TVP18	Q04767	167 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	RPB11	P38902	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	LCL1	Q02786	101 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	PLP1	Q04004	230 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	GPI19	Q04082	140 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	GIM5	Q04493	163 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	SRP14	P38985	146 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	DAD3	P69850	94 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	NAT3	Q06504	195 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	QRI5	P32344	111 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	YIL059C	P40520	121 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	HIT1	P46973	164 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	DCN1	Q12395	269 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YOX1	YML027W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	ZRT1	P32804	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	PAU7	P39545	55 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	PHS1	P40857	217 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	PAU5	P43575	122 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	SNN1	P48232	102 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	GTO3	Q04806	366 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	DCV1	P43595	202 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	YGR149W	P48236	432 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	MRPS9	P38120	278 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	RPC10	P40422	70 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	UBC12	P52491	188 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	MMS2	P53152	137 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	SNA2	P56508	79 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YOX1	YML027W	LDS1	P31379	325 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	YBR209W	P38311	105 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	VMA7	P39111	118 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	YER076C	P40049	302 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	CIN5	P40917	295 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	OST3	P48439	350 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	POM33	Q12164	279 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	SDH8	P38345	138 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	YAL064W	P39711	94 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	ENV10	Q99382	181 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	BNS1	P50084	137 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	LAC1	P28496	418 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	HSP10	P38910	106 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	YGL088W	P53151	121 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	APS2	Q00381	147 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	YGL010W	P25338	174 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	AIM29	P36154	155 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	SMP1	P38128	452 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	GLO1	P50107	326 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	FMP16	Q12497	93 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	YKR032W	P36127	104 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	DAN1	P47178	298 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YOX1	YML027W	TRP1	P00912	224 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	PCL2	P25693	308 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	SRB6	P32570	121 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	PAM17	P36147	197 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	YAR029W	P39549	74 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	YER085C	P40058	173 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	YIL024C	P40543	189 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	SDS23	P53172	527 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YOX1	YML027W	AIM19	P40502	157 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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