RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	SPG1	P50088	95 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YGL118C	P53132	145 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YGR026W	P53217	278 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YNR064C	P53750	290 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YDR274C	P87283	123 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	API2	Q04413	109 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YOL029C	Q08187	201 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	FIT3	Q08907	204 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	ATP20	Q12233	115 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	COA6	Q3E846	104 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	ODC2	Q99297	307 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	3.01	□□□□□ -1.93	not detected
PAM18	YLR008C	PAU15	P40585	124 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	HAL1	Q01766	294 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	RIM9	Q04734	239 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	RRT7	Q07829	113 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YDR029W	Q12111	104 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	JID1	Q12350	301 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	COX19	Q3E731	98 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	STT4	P37297	1900 aa		3	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	UBC4	P15731	148 aa		3	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	MDH2	P22133	377 aa		3	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	CTR2	P38865	189 aa		3	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	ERG25	P53045	309 aa		3	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	NCE101	Q02820	53 aa		3	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	MRPS8	Q03799	155 aa		3	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YLR281C	Q05863	155 aa		3	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	IRC19	Q07843	230 aa		3	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	CSI2	Q08054	341 aa		3	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	COX5B	P00425	151 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YGL010W	P25338	174 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	MRPS9	P38120	278 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	GPI18	P38211	433 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YHL042W	P38729	150 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	HSP10	P38910	106 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	FLX1	P40464	311 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	VMA21	P41806	77 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	DAN1	P47178	298 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	DSK2	P48510	373 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	SEN15	Q04675	128 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	ECM19	Q06011	112 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	HRT1	Q08273	121 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	RPB9	P27999	122 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	SSS1	P35179	80 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	RRT1	P38192	103 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	UMP1	P38293	148 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YHR125W	P38831	101 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YHR180W	P38868	163 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	PIR5	P46999	287 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	LIP1	Q03579	150 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	AVO2	Q04749	426 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	SRL1	Q08673	210 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	MIC10	Q96VH5	97 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	ECM12	O13529	151 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	PAU19	P0CE85	124 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	PAU21	P0CE86	164 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	PAU22	P0CE87	164 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	PAU3	P25610	124 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	YBR013C	P38215	129 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	KNH1	P50112	268 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	MPC3	P53311	146 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	RAF1	Q06891	181 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PAM18	YLR008C	PAU1	P0CE88	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	PAU14	P0CE89	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	PAU6	P0CE90	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	PAU18	P0CE91	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	PAU8	P0CE92	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	PAU11	P0CE93	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	PAU13	P38725	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	CAX4	P53223	239 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	PAU4	P53427	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	PAU10	Q03050	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	PAU20	Q08322	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	YOR343C	Q12484	108 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	PAU9	Q3E770	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	SCS22	Q6Q595	175 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	TOM1	Q03280	3268 aa		2.96	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	QCR9	P22289	66 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	MIG1	P27705	504 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	YKL044W	P36092	106 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	SNF11	P38956	169 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	TDA2	P40045	126 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	YNL217W	P40152	326 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	PAU5	P43575	122 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	IGD1	P43598	195 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PAM18	YLR008C	ECO1	P43605	281 aa		2.95	□□□□□ -1.94

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