RNA–Protein interactions for RNA: YKR041W

YKR041W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR041W, Length 753 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR041W	YKR041W	YHR140W	P38842	239 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	MBB1	P39534	108 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	YPL073C	P40323	161 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	IMP2	P46972	177 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	UBC11	P52492	156 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	MGR2	Q02889	113 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	ELC1	Q03071	99 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	MIX17	Q03667	156 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	GAT3	Q07928	141 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	COX17	Q12287	69 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	RPL39	P04650	51 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	YPT53	P36019	220 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	YHL037C	P38733	133 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	YNL198C	P40166	100 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	API2	Q04413	109 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	SCW10	Q04951	389 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	GEP3	Q08622	556 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YKR041W	YKR041W	PFY1	P07274	126 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	TOS6	P48560	102 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	TIM22	Q12328	207 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	IES6	P32617	166 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YKR041W	P36134	250 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	ECM14	P38836	430 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YER181C	P40097	107 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YNL217W	P40152	326 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YMR141C	P40211	102 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YFL015C	P43578	164 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	PHO85	P17157	305 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YER076C	P40049	302 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YER121W	P40076	114 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	HUA1	P40325	198 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	POR2	P40478	281 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	DIA1	P54005	336 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	DGA1	Q08650	418 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YKR032W	P36127	104 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YKR045C	P36138	183 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	PET8	P38921	284 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YJL213W	P40896	331 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	SED1	Q01589	338 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YKL070W	P36087	169 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	SPI1	P40092	148 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YFL051C	P43552	160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	ATP23	P53722	227 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	JID1	Q12350	301 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	CCW14	O13547	238 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	ATX1	P38636	73 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	YIP3	P53633	176 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	TIM10	P87108	93 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKR041W	YKR041W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	SNF11	P38956	169 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	LCB3	P47013	409 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	YGR219W	P53307	113 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	CTR2	P38865	189 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	GLE2	P40066	365 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	KEG1	P43614	200 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	VAR1	P02381	398 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	MIC12	P38341	106 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	OXA1	P39952	402 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	OST2	P46964	130 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	SBH2	P52871	88 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	HPA2	Q06592	156 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	PRM3	Q08931	133 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	AGA1	P32323	725 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	ABM1	P47146	123 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	GLO1	P50107	326 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR041W	YKR041W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.18	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.3 ms