RNA–Protein interactions for RNA: YKR019C

IRS4, Transcript of EH domain-containing protein, yeast

Gene IRS4, Length 1,848 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IRS4	YKR019C	FLO5	P38894	1075 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	YNL217W	P40152	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	YHR125W	P38831	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	MPC3	P53311	146 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	ATP19	P81451	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	YLR296W	Q05898	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	YCR085W	P25650	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	QCR10	P37299	77 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	NRG2	P38082	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	YIL054W	P40524	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	MIX14	Q04341	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	SDH3	P33421	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	PEP8	P40335	379 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	PRM3	Q08931	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	CRC1	Q12289	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	RRT15	Q3E811	62 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRS4	YKR019C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	FYV5	P25585	152 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	RPB9	P27999	122 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	YEL045C	P32616	141 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	ECO1	P43605	281 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	SOM1	Q05676	74 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	FKS3	Q04952	1785 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	SVP26	P38869	228 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	HUR1	P45820	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	SWM2	P40342	146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	YHP1	Q04116	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	IRC25	Q07951	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	MID2	P36027	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	VMA21	P41806	77 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	YDR042C	Q03205	200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	EMC6	Q12431	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	RNQ1	P25367	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	YOL131W	Q08270	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	ENV10	Q99382	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	DAD1	Q12248	94 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	MDM35	O60200	86 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	YER187W	P40102	141 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	IGD1	P43598	195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	GRX5	Q02784	150 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	IRC19	Q07843	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	KRE1	P17260	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	FZF1	P32805	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	YKR045C	P36138	183 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	IGO1	P53897	168 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IRS4	YKR019C	COX4	P04037	155 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	YDL241W	Q07738	123 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	YCR043C	P25361	127 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	ATX1	P38636	73 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	RRT13	P40042	185 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	IRC23	Q08416	157 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	YPL261C	Q08976	102 aa		4.5	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.5	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.5	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	MSB2	P32334	1306 aa		4.5	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	PAU21	P0CE86	164 aa		4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	PAU22	P0CE87	164 aa		4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	ECM34	P38728	170 aa		4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	HSP10	P38910	106 aa		4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	MIG3	P39943	394 aa		4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	NAT5	Q08689	176 aa		4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	MYO1	P08964	1928 aa		4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	ASK1	P35734	292 aa		4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	REE1	P40893	198 aa		4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	PAU12	P53343	120 aa		4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	SUN4	P53616	420 aa		4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	PBA1	Q05778	276 aa		4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.49	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		4.48	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.48	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	PAU2	P32612	120 aa		4.48	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	TOM6	P33448	61 aa		4.48	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
IRS4	YKR019C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 72.7 ms