RNA–Protein interactions for RNA: YJR084W

YJR084W, Transcript of Protein that forms a complex with Thp3p, yeast

Gene YJR084W, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR084W	YJR084W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YJR084W	YJR084W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YJR084W	YJR084W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	CUP2	P15315	225 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	YGR026W	P53217	278 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	POM33	Q12164	279 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	VAR1	P02381	398 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	Q0255	P03881	472 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	AGA1	P32323	725 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	MIX23	P38162	196 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	NSE4	P43124	402 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	GTO3	Q04806	366 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	PAU3	P25610	124 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	YHR140W	P38842	239 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	SUR2	P38992	349 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	YCH1	P42937	148 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	PAM17	P36147	197 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	UIP3	P39547	235 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	YGR017W	P53210	297 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	ZRT1	P32804	376 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
YJR084W	YJR084W	BRP1	P53194	125 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	SGF11	Q03067	99 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	GPI19	Q04082	140 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	SCW10	Q04951	389 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	VAM10	Q08474	114 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	NRG2	P38082	220 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	VHS2	P40463	436 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	AIM34	Q03673	198 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJR084W	YJR084W	YCR001W	P25347	104 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	AUA1	P32450	94 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	YBR013C	P38215	129 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	YFR035C	P43608	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	SDS23	P53172	527 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	TVP18	Q04767	167 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	DXO1	Q06349	442 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	MRPL28	P36527	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	TEM1	P38987	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	RRT13	P40042	185 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	YPS5	P53057	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	HAL1	Q01766	294 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	YNL217W	P40152	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	YGR149W	P48236	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	CYT2	Q00873	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	ATP16	Q12165	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	YGL118C	P53132	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	ARL3	Q02804	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	DGA1	Q08650	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	YCR043C	P25361	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	PMP3	P87284	55 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJR084W	YJR084W	YCR023C	P25351	611 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	YKR032W	P36127	104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	KRE9	P39005	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	DCV1	P43595	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	SAL1	D6W196	494 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	PFY1	P07274	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	YER076C	P40049	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	SPC1	P46965	94 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	ERV14	P53173	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	PET8	P38921	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	MGR2	Q02889	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	SSS1	P35179	80 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	TOS6	P48560	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJR084W	YJR084W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.3 ms