RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	GTO3	Q04806	366 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	LCB3	P47013	409 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	CAX4	P53223	239 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	YMR181C	Q03231	154 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	GPI19	Q04082	140 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	CNL1	Q06333	122 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	PPT2	Q12036	173 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	CUP2	P15315	225 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	ZRT1	P32804	376 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	MIC26	P50087	233 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	BRP1	P53194	125 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	YMR244W	Q04018	355 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	DXO1	Q06349	442 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	AGA1	P32323	725 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	FZF1	P32805	299 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	SSS1	P35179	80 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	MRPL28	P36527	147 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	TEM1	P38987	245 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	MST28	P39552	234 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	YMR141C	P40211	102 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	YGR149W	P48236	432 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	MST27	P53176	234 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	ARL3	Q02804	198 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	YPR013C	Q12145	317 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	PRM7	Q12459	698 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	MIG1	P27705	504 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	YER135C	P40082	130 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	AIM34	Q03673	198 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	TVP18	Q04767	167 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	PAM17	P36147	197 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	YBR090C	P38253	122 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	SIM1	P40472	476 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	ERV14	P53173	138 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	COX12	Q01519	83 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	MGR2	Q02889	113 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	PFY1	P07274	126 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	PAU16	P35994	123 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	MIG3	P39943	394 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	VHS2	P40463	436 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	TOS6	P48560	102 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	SDS23	P53172	527 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	VAM10	Q08474	114 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	FYV7	Q12247	151 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CPR4	YCR069W	Q0255	P03881	472 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	AGE2	P40529	298 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	OST3	P48439	350 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	YCR007C	P25354	239 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	YCR023C	P25351	611 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	MRP49	P32388	137 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	YAR029W	P39549	74 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	YER076C	P40049	302 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	HUA1	P40325	198 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	YPS5	P53057	165 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	YGR017W	P53210	297 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	SGF11	Q03067	99 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	YDR042C	Q03205	200 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	SAL1	D6W196	494 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	APS1	P35181	156 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	RRT13	P40042	185 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	YFR035C	P43608	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	PMP3	P87284	55 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	VPS71	Q03433	280 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPR4	YCR069W	TRP1	P00912	224 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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