RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	YGR219W	P53307	113 aa		3.87	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	DIA1	P54005	336 aa		3.87	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	YMR103C	Q04436	120 aa		3.87	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	YLR296W	Q05898	108 aa		3.87	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	PCL2	P25693	308 aa		3.86	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	MIC12	P38341	106 aa		3.86	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	SNF11	P38956	169 aa		3.86	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	YPL073C	P40323	161 aa		3.86	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	CIN5	P40917	295 aa		3.86	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	YLR112W	Q12130	139 aa		3.86	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	AQY1	P0CD91	305 aa		3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	MLF3	P32047	452 aa		3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	YNL198C	P40166	100 aa		3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	AGE2	P40529	298 aa		3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	ATP23	P53722	227 aa		3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	ELC1	Q03071	99 aa		3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	IZH3	Q07959	543 aa		3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	YOL160W	Q08321	113 aa		3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	IRC23	Q08416	157 aa		3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	DGA1	Q08650	418 aa		3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	FCY1	Q12178	158 aa		3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	SPO24	Q3E752	67 aa		3.85	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	YKL070W	P36087	169 aa		3.84	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	POP7	P38291	140 aa		3.84	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	YNL194C	P40169	301 aa		3.84	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	LCB3	P47013	409 aa		3.84	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	ABM1	P47146	123 aa		3.84	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	NCE103	P53615	221 aa		3.84	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	YPL257W	Q08974	193 aa		3.84	□□□□□ -1.79
UBX7	YBR273C	YKR041W	P36134	250 aa		3.83	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	YLR122C	Q12312	125 aa		3.83	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	HMRA2	P0CY13	119 aa		3.82	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	AGA1	P32323	725 aa		3.82	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	YER181C	P40097	107 aa		3.82	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	YNL217W	P40152	326 aa		3.82	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	KEG1	P43614	200 aa		3.82	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	SLO1	Q3E784	85 aa		3.82	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	COA3	Q3E7B2	85 aa		3.82	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	SPS100	P13130	326 aa		3.81	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	DUT1	P33317	147 aa		3.81	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	YIR020C	P40575	100 aa		3.81	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	GLO1	P50107	326 aa		3.81	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	YPL261C	Q08976	102 aa		3.81	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	CCW12	Q12127	133 aa		3.81	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		3.81	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	IGO2	Q9P305	131 aa		3.81	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	CCW14	O13547	238 aa		3.8	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	INO2	P26798	304 aa		3.8	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	YHR022C	P38763	256 aa		3.8	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	TIM10	P87108	93 aa		3.8	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	YMR181C	Q03231	154 aa		3.8	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	SCW10	Q04951	389 aa		3.8	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	VAR1	P02381	398 aa		3.79	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	OXA1	P39952	402 aa		3.79	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	YIP3	P53633	176 aa		3.79	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.79	□□□□□ -1.8	not detected
UBX7	YBR273C	PRM3	Q08931	133 aa		3.79	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		3.79	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	CYC7	P00045	113 aa		3.78	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	VMA11	P32842	164 aa		3.78	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	YPT53	P36019	220 aa		3.78	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	YML122C	Q03207	126 aa		3.78	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		3.78	□□□□□ -1.8
UBX7	YBR273C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	DCV1	P43595	202 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	VPS55	P47111	140 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	TOS8	P53147	276 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YNR077C	P53758	84 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YLR194C	Q05777	254 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	RRG8	Q06109	277 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YEL067C	P39978	195 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	AIM11	P87275	137 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	AIM34	Q03673	198 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	SPG4	Q04438	115 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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