RNA–Protein interactions for RNA: YNL242W

ATG2, Transcript of Peripheral membrane protein required for autophagic vesicle formation, yeast

Gene ATG2, Length 4,779 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG2	YNL242W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	HMRA1	P0CY11	126 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YHP1	Q04116	353 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	MCH2	P36032	473 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	MIC27	P50945	234 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	RAF1	Q06891	181 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	MRS3	P10566	314 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	VMA3	P25515	160 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YCH1	P42937	148 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YGR050C	P53231	118 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YOR292C	Q08743	309 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	SRP14	P38985	146 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YLR042C	Q07990	161 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YKL102C	P34249	101 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	LCL3	P53153	274 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	RTG1	P32607	177 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	APS1	P35181	156 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	ATP23	P53722	227 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	SVP26	P38869	228 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YPL278C	Q08990	100 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YDR215C	Q12240	137 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	KNH1	P50112	268 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	VPS71	Q03433	280 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	SDH7	Q04401	133 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	SRP21	P32342	167 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	RPS27B	P38711	82 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YER085C	P40058	173 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YPR098C	Q06089	161 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	TOM7	P53507	60 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	MRPL39	P36533	70 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	SFT2	P38166	215 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	NCE103	P53615	221 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	HPA2	Q06592	156 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	CPD1	P53314	239 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	RAV2	Q03956	351 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YLR415C	O13578	112 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	EGT2	P42835	1041 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	API2	Q04413	109 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	FCY1	Q12178	158 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	IMP1	P28627	190 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	QRI5	P32344	111 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	ISF1	P32488	338 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YMR254C	Q04838	102 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YDR209C	Q03480	137 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	AYT1	Q12226	474 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	CPT1	P17898	393 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YPT10	P38146	199 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YIL102C	P40488	101 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YIA6	P40556	373 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	NRM1	P53718	249 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	BET5	Q03630	159 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	TIM18	Q08749	192 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	GPI18	P38211	433 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	YIL029C	P40538	142 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	TSC3	Q3E790	80 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATG2	YNL242W	MIC12	P38341	106 aa		3.34	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	YJL213W	P40896	331 aa		3.34	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	YJL118W	P47022	219 aa		3.34	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	HSK3	P69852	69 aa		3.34	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	STF1	P01098	86 aa		3.34	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	FZF1	P32805	299 aa		3.34	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	RRT1	P38192	103 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	SRL1	Q08673	210 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	YER181C	P40097	107 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	YPL073C	P40323	161 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	YGL088W	P53151	121 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	PAU7	P39545	55 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	TDA2	P40045	126 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	YIP3	P53633	176 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATG2	YNL242W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.1 ms