RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	YPR013C	Q12145	317 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	RTC6	O14464	93 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	VMA16	P23968	213 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	FPR2	P32472	135 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	NNK1	P36003	928 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YPT10	P38146	199 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	OST3	P48439	350 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	DSK2	P48510	373 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	TIM22	Q12328	207 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	MRS1	P07266	363 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YCR022C	P25620	114 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	MSK1	P32048	576 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YBL059W	P34224	193 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YER085C	P40058	173 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	GTT1	P40582	234 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	TAD2	P47058	250 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YJR096W	P47137	282 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YGR018C	P53211	109 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	NRG1	Q03125	231 aa		2.37	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	DDI2	P0CH63	225 aa		2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	DDI3	P0CH64	225 aa		2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	UPS3	Q04006	179 aa		2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YIL163C	P40448	117 aa		2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YGL088W	P53151	121 aa		2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YMR082C	Q04276	118 aa		2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	DCN1	Q12395	269 aa		2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YHR213W	P0CI67	198 aa		2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	CNB1	P25296	175 aa		2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	AIM29	P36154	155 aa		2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YBR013C	P38215	129 aa		2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	SNO1	Q03144	224 aa		2.36	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	PAU1	P0CE88	120 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	PAU14	P0CE89	120 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	PAU6	P0CE90	120 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	PAU18	P0CE91	120 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	PAU8	P0CE92	120 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	PAU11	P0CE93	120 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	PAU13	P38725	120 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YHR022C	P38763	256 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	MMS2	P53152	137 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YGR025W	P53216	100 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	ARL3	Q02804	198 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	PAU10	Q03050	120 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	AIM34	Q03673	198 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	PAU20	Q08322	120 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	PAU9	Q3E770	120 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	COA2	Q3E823	68 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YHR173C	P38864	112 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	ATP23	P53722	227 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	HCH1	P53834	153 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YDR366C	P87287	132 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YML122C	Q03207	126 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	GTO3	Q04806	366 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	DIF1	O13577	133 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	MRP10	O75012	95 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YFR045W	P43617	309 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	FIT2	Q08906	153 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	PRR2	Q12310	699 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		2.35	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	AUA1	P32450	94 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	SPS18	P32572	300 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YHR140W	P38842	239 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YGR026W	P53217	278 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	YDR029W	Q12111	104 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	POM33	Q12164	279 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	ATP14	Q12349	124 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	PUT1	P09368	476 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	GLE2	P40066	365 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	ABF2	Q02486	183 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	RAV2	Q03956	351 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	ATG33	Q06485	197 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	ANT1	Q06497	328 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	RRT15	Q3E811	62 aa		2.34	□□□□□ -2.03
STE6	YKL209C	ELF1	P36053	145 aa		2.34	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	MRPS9	P38120	278 aa		2.34	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	CIN5	P40917	295 aa		2.34	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YCH1	P42937	148 aa		2.34	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	HIT1	P46973	164 aa		2.34	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	2.34	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YGL010W	P25338	174 aa		2.33	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	RPB11	P38902	120 aa		2.33	□□□□□ -2.04

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 88.1 ms